More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4819 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 543 aa  1040    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  40.27 
 
 		 572 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.37 
 
 		 595 aa  341  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 		 567 aa  326  8.000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  41.97 
 
 		 591 aa  323  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.66 
 
 		 568 aa  319  9e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.96 
 
 		 571 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  43.51 
 
 		 573 aa  306  8.000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.15 
 
 		 566 aa  303  7.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 		 566 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 		 559 aa  300  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.68 
 
 		 566 aa  300  6e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.68 
 
 		 566 aa  300  6e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.68 
 
 		 566 aa  300  6e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  42.26 
 
 		 578 aa  298  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.78 
 
 		 573 aa  294  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 575 aa  287  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 		 568 aa  286  7e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 		 568 aa  286  7e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  42.49 
 
 		 588 aa  285  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 		 568 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  39.74 
 
 		 577 aa  280  5e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 		 544 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 		 592 aa  265  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 		 580 aa  262  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 		 578 aa  260  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  39.13 
 
 		 573 aa  258  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 		 579 aa  253  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  36.85 
 
 		 565 aa  253  7e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  35.92 
 
 		 549 aa  251  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 568 aa  242  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 535 aa  239  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 		 631 aa  235  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 590 aa  217  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 		 556 aa  215  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 571 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  33.59 
 
 		 543 aa  199  9e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 525 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 535 aa  178  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 550 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23240  histidine kinase with GAF domain protein  33.33 
 
 		 635 aa  161  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 372 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  35.91 
 
 		 391 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 409 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  57.53 
 
 		 392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  34.68 
 
 		 385 aa  146  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  33.08 
 
 		 401 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  44.09 
 
 		 536 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 381 aa  131  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18330  histidine kinase  38.03 
 
 		 382 aa  111  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  35.03 
 
 		 851 aa  101  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  35 
 
 		 484 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  34.84 
 
 		 828 aa  98.2  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 665 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 421 aa  95.1  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  30 
 
 		 547 aa  94  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  32.7 
 
 		 673 aa  90.9  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  30.38 
 
 		 373 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 464 aa  89.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4870  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 566 aa  86.7  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125677  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.26 
 
 		 725 aa  86.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38430  PAS domain S-box  32.31 
 
 		 552 aa  84  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  28.77 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2317  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.87 
 
 		 598 aa  82  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01200  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarL  28.42 
 
 		 598 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2424  histidine kinase  28.42 
 
 		 598 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0527369  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1705  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.42 
 
 		 598 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.55706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01210  hypothetical protein  28.42 
 
 		 598 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.678292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1372  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.42 
 
 		 598 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.497152  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2401  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.42 
 
 		 598 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1918  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.84 
 
 		 598 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184147  normal  0.168413 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1331  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.42 
 
 		 598 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.150699  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 373 aa  80.1  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4655  putative PAS/PAC sensor protein  35.97 
 
 		 535 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 545 aa  78.2  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1389  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.08 
 
 		 598 aa  78.2  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0922186  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 574 aa  77.4  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.693223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0022  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 487 aa  77  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1902  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.83 
 
 		 598 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5592  sensor histidine kinase  19.93 
 
 		 523 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00145033  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 682 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1374  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.83 
 
 		 613 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3278  ATPase domain-containing protein  31.75 
 
 		 563 aa  75.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.471224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1897  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.83 
 
 		 598 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.149462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1961  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.83 
 
 		 598 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.68817 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1557  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.83 
 
 		 598 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0417714 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3510  histidine kinase  31.75 
 
 		 559 aa  75.1  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.026405 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  22.4 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3436  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 606 aa  74.3  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637225  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2842  diguanylate cyclase  25.67 
 
 		 785 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1937  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  22.48 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000507079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  23.61 
 
 		 523 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1903  GAF sensor signal transduction histidine kinase  22.48 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000111521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>