More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3096 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 578 aa  1153    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.55 
 
 		 566 aa  470  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  42.58 
 
 		 572 aa  423  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 		 571 aa  414  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.79 
 
 		 559 aa  415  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.99 
 
 		 566 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.99 
 
 		 566 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.99 
 
 		 566 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.62 
 
 		 567 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  43.59 
 
 		 591 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.6 
 
 		 566 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 568 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 568 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 568 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 		 595 aa  379  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  43.21 
 
 		 573 aa  375  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 568 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  39.6 
 
 		 549 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.14 
 
 		 573 aa  364  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  43.5 
 
 		 578 aa  364  2e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 		 575 aa  360  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  39.82 
 
 		 543 aa  343  7e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  39.3 
 
 		 577 aa  339  8e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  43.13 
 
 		 573 aa  335  1e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 		 588 aa  322  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 		 544 aa  322  1.9999999999999998e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 565 aa  317  4e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 568 aa  304  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 		 580 aa  301  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 579 aa  292  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  39.29 
 
 		 536 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 		 592 aa  281  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 		 543 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 556 aa  273  5.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 631 aa  254  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23240  histidine kinase with GAF domain protein  34.72 
 
 		 635 aa  246  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 		 590 aa  237  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 525 aa  217  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 535 aa  217  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 571 aa  209  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  52.25 
 
 		 535 aa  171  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 		 392 aa  168  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 550 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.21 
 
 		 381 aa  150  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 456 aa  143  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  31.98 
 
 		 401 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  31.81 
 
 		 391 aa  135  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  34.88 
 
 		 385 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 409 aa  120  7e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 372 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 386 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  36.26 
 
 		 373 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  29.6 
 
 		 673 aa  98.6  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  31.42 
 
 		 828 aa  97.8  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 421 aa  97.8  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  30.29 
 
 		 851 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18330  histidine kinase  34.76 
 
 		 382 aa  94.4  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 393 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 345 aa  91.3  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  33.67 
 
 		 484 aa  90.5  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 373 aa  87  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 574 aa  86.3  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 517 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 469 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4655  putative PAS/PAC sensor protein  34.26 
 
 		 535 aa  85.1  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3749  putative signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 1018 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0973084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2407  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  31.25 
 
 		 572 aa  83.2  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 		 665 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  26.37 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2712  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  29.92 
 
 		 572 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.68 
 
 		 682 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  27.14 
 
 		 547 aa  79  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3436  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 606 aa  78.2  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637225  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1423  sensor histidine kinase VraS  29.8 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0022  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 		 487 aa  77.4  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1939  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1973  histidine kinase  29.95 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4209  putative PAS/PAC sensor protein  29.85 
 
 		 795 aa  77  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 485 aa  77  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 709 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  31.31 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1331  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.41 
 
 		 598 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.150699  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1389  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.41 
 
 		 598 aa  74.7  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0922186  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2634  histidine kinase  31.12 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000175326  hitchhiker  0.00557176 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01200  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarL  28.41 
 
 		 598 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2424  histidine kinase  28.41 
 
 		 598 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0527369  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1705  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.41 
 
 		 598 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.55706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1918  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.41 
 
 		 598 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184147  normal  0.168413 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2401  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.41 
 
 		 598 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01210  hypothetical protein  28.41 
 
 		 598 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.678292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1372  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.41 
 
 		 598 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.497152  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 654 aa  74.3  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  31.12 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  32.47 
 
 		 650 aa  73.9  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 476 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1374  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.11 
 
 		 613 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1557  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.11 
 
 		 598 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0417714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>