More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3460 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 556 aa  1108    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.1 
 
 		 535 aa  499  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  52.81 
 
 		 565 aa  481  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 		 568 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 		 571 aa  363  3e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 		 567 aa  361  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  39.93 
 
 		 572 aa  360  5e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  40.64 
 
 		 591 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.89 
 
 		 566 aa  341  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  39.71 
 
 		 573 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  41.62 
 
 		 579 aa  335  9e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  39.78 
 
 		 577 aa  335  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 		 566 aa  330  6e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 		 573 aa  329  7e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 		 580 aa  326  8.000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  40.63 
 
 		 536 aa  325  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 		 588 aa  320  5e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 559 aa  316  7e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 		 592 aa  314  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 		 595 aa  307  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 568 aa  306  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 568 aa  306  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 		 568 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 566 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 566 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 566 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  38.46 
 
 		 578 aa  299  9e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 544 aa  287  4e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 575 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 525 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  37.48 
 
 		 573 aa  280  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 		 535 aa  280  6e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 631 aa  277  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 578 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  34.79 
 
 		 549 aa  265  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 568 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 		 543 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 590 aa  227  6e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  33.15 
 
 		 543 aa  219  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 571 aa  215  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 550 aa  167  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  53.01 
 
 		 392 aa  167  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23240  histidine kinase with GAF domain protein  30.97 
 
 		 635 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 381 aa  156  8e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  33.77 
 
 		 401 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.68 
 
 		 456 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  29.7 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  50.3 
 
 		 386 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 409 aa  131  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  31.77 
 
 		 385 aa  128  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  39.88 
 
 		 373 aa  114  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 421 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 393 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 		 373 aa  105  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  32.72 
 
 		 828 aa  104  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  30.92 
 
 		 851 aa  103  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  31.75 
 
 		 673 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  26.21 
 
 		 377 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0022  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 487 aa  96.7  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 682 aa  94  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 		 725 aa  90.9  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1423  sensor histidine kinase VraS  29.33 
 
 		 348 aa  90.5  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 		 665 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 652 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 344 aa  89.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 748 aa  88.6  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 345 aa  88.2  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 574 aa  88.6  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2123  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.82 
 
 		 593 aa  87.8  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2232  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.82 
 
 		 593 aa  87.8  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1557  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.88 
 
 		 598 aa  87.8  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0417714 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1961  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.88 
 
 		 598 aa  87.8  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.68817 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 332 aa  87.4  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1897  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.88 
 
 		 598 aa  87.8  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.149462 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1374  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.88 
 
 		 613 aa  87.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 352 aa  87  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1937  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  24.9 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000507079  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1973  histidine kinase  28.17 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2522  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.44 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1903  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000111521  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1939  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1902  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.51 
 
 		 598 aa  84.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2261  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.19 
 
 		 602 aa  84  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0999245  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1687  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  32.48 
 
 		 643 aa  84.3  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  24.18 
 
 		 1809 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1668  histidine kinase  32.14 
 
 		 298 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  30.61 
 
 		 323 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  32.67 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  30.96 
 
 		 484 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  33.18 
 
 		 515 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01200  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarL  27.65 
 
 		 598 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2424  histidine kinase  27.65 
 
 		 598 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0527369  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2567  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.41 
 
 		 623 aa  80.9  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1372  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.65 
 
 		 598 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.497152  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01210  hypothetical protein  27.65 
 
 		 598 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.678292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2401  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.65 
 
 		 598 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1705  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.65 
 
 		 598 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.55706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1918  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.65 
 
 		 598 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184147  normal  0.168413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>