More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1421 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 484 aa  948    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  39.53 
 
 		 572 aa  126  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 		 567 aa  126  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 		 568 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  40.87 
 
 		 591 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.94 
 
 		 566 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 		 573 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  38.12 
 
 		 573 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 544 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  35.78 
 
 		 543 aa  108  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  38.6 
 
 		 577 aa  106  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 571 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 631 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 580 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 592 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  35.02 
 
 		 536 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 566 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 535 aa  98.6  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 568 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 568 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 566 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 566 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 566 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  33.02 
 
 		 578 aa  97.1  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  34.93 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 579 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  29.32 
 
 		 640 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 568 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 565 aa  94  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  30.82 
 
 		 549 aa  93.6  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 590 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  31.18 
 
 		 489 aa  92  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 543 aa  90.9  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 578 aa  90.5  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 525 aa  90.5  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 658 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 559 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  30.04 
 
 		 391 aa  87.8  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 595 aa  87.4  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 392 aa  87  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 575 aa  87  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 588 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 535 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 662 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  29.04 
 
 		 662 aa  83.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 556 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 571 aa  79.7  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18330  histidine kinase  28 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 568 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1357  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.36 
 
 		 539 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.977036  normal  0.0183554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  30.08 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 550 aa  75.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.69 
 
 		 539 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296337  normal  0.408298 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  22.41 
 
 		 461 aa  72  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 529 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08896  putative transmembrane protein  21.1 
 
 		 680 aa  70.9  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0921  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.86 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  25.78 
 
 		 597 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 485 aa  70.1  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5293  stage II sporulation E family protein  31.5 
 
 		 632 aa  70.1  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.948365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  32.84 
 
 		 573 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0766  histidine kinase  25.15 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.701174  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 469 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 459 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  24.65 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3485  histidine kinase  29.9 
 
 		 565 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1767  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.34 
 
 		 604 aa  67.8  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 529 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.633654  normal  0.687189 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  26.55 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 480 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 480 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0123  sensor histidine kinase  23.05 
 
 		 466 aa  67  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.92 
 
 		 562 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743011  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0021  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  28.57 
 
 		 487 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  27.03 
 
 		 373 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 480 aa  66.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2714  putative signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 614 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 775 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 459 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3041  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 691 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3085  putative two component signal transduction protein  25.83 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 553 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3087  PAS sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  22.98 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1533  histidine kinase  33.72 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  28.96 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 564 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 638 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8461  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  26.01 
 
 		 528 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 700 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 527 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151228  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 		 682 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  26.78 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>