More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1423 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1423  sensor histidine kinase VraS  100 
 
 		 348 aa  706    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1973  histidine kinase  93.02 
 
 		 347 aa  613  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1939  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  93.02 
 
 		 347 aa  613  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.12 
 
 		 344 aa  232  6e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  41.88 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  41.88 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  41.88 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  41.88 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  41.88 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  41.56 
 
 		 351 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  41.88 
 
 		 351 aa  216  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  41.88 
 
 		 351 aa  216  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  41.23 
 
 		 351 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  41.23 
 
 		 351 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 355 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0321  sensor histidine kinase, putative  32.77 
 
 		 339 aa  176  4e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 682 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 682 aa  123  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 725 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  30.49 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 352 aa  116  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 775 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  30 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 501 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  31.94 
 
 		 515 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 546 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  30.88 
 
 		 680 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  30.88 
 
 		 619 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 665 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  30.88 
 
 		 680 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 662 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 450 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  34.68 
 
 		 662 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  33.67 
 
 		 489 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  27.41 
 
 		 482 aa  106  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2882  Histidine kinase  28.74 
 
 		 413 aa  106  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00350907  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  35.81 
 
 		 523 aa  106  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  31.17 
 
 		 640 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  33.62 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 658 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 541 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1356  histidine kinase  34.38 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 665 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  30.43 
 
 		 687 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 421 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 523 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  31.16 
 
 		 2361 aa  102  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3079  sensor histidine kinase  34.83 
 
 		 372 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000507367 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2292  sensor histidine kinase  35.82 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 373 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  31.07 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 535 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5416  sensor histidine kinase  35.21 
 
 		 516 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5507  sensor histidine kinase  34.88 
 
 		 523 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2374  sensor histidine kinase  35.61 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0968027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5092  two-component sensor protein  34.88 
 
 		 523 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5109  sensor histidine kinase  34.88 
 
 		 523 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 545 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  31.07 
 
 		 585 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3793  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 703 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5541  sensor histidine kinase, putative  34.74 
 
 		 523 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2032  sensor histidine kinase  26.96 
 
 		 609 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.509946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5592  sensor histidine kinase  34.74 
 
 		 523 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  28.95 
 
 		 1048 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  32.68 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  35.32 
 
 		 372 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  35.32 
 
 		 372 aa  99.4  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  29.13 
 
 		 683 aa  99.4  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4605  histidine kinase  28.14 
 
 		 403 aa  99.4  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 748 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2244  sensor histidine kinase  35.47 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  35.32 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  36.95 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 480 aa  99  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  31.03 
 
 		 381 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 492 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2045  sensor histidine kinase  35.32 
 
 		 372 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  31.07 
 
 		 463 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  31.07 
 
 		 492 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  31.07 
 
 		 492 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  31.98 
 
 		 463 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  28.57 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 544 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 474 aa  97.8  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  34.12 
 
 		 451 aa  97.8  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  31.07 
 
 		 492 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  31.07 
 
 		 492 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 545 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0289  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  31.56 
 
 		 474 aa  97.8  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5264  two-component sensor protein, C-terminus  36.5 
 
 		 193 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 1168 aa  97.4  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  31.07 
 
 		 463 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  34.29 
 
 		 470 aa  97.8  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0384  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 348 aa  97.4  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1903  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 370 aa  97.1  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000111521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 535 aa  97.1  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>