More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3749 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.58 
 
 		 1030 aa  835    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223882  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3749  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1018 aa  2091    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0973084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0622  histidine kinase  30.7 
 
 		 1013 aa  420  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378276 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2339  histidine kinase  30.39 
 
 		 1009 aa  344  5e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2667  histidine kinase  28.73 
 
 		 1017 aa  301  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.865327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 1211 aa  264  6e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.58 
 
 		 1453 aa  250  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  24.39 
 
 		 1024 aa  221  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1225  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  24.84 
 
 		 985 aa  220  8.999999999999998e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.90661  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02778  GGDEF protein  24.73 
 
 		 946 aa  215  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2733  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  23.38 
 
 		 965 aa  204  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  23.2 
 
 		 1363 aa  194  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1301  two component regulator propeller domain protein  25.19 
 
 		 1008 aa  192  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.503431  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  24.97 
 
 		 1075 aa  186  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  23.42 
 
 		 1370 aa  184  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  22.39 
 
 		 1397 aa  179  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  24.91 
 
 		 1407 aa  173  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.11 
 
 		 1258 aa  172  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  21.32 
 
 		 1334 aa  170  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  23.8 
 
 		 1105 aa  169  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0967  GGDEF family protein  23.52 
 
 		 976 aa  164  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1127  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  23.58 
 
 		 1306 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  22.81 
 
 		 1017 aa  161  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  25.2 
 
 		 967 aa  160  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  24.42 
 
 		 1346 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  22.62 
 
 		 1342 aa  155  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  20.97 
 
 		 1054 aa  154  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  23.89 
 
 		 1335 aa  154  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  22.34 
 
 		 1526 aa  152  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.1 
 
 		 1498 aa  153  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  21.59 
 
 		 1378 aa  147  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1617  ATP-binding region ATPase domain protein  22.58 
 
 		 975 aa  145  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  22.48 
 
 		 1355 aa  145  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  24.08 
 
 		 1278 aa  144  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  22.77 
 
 		 1374 aa  142  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  22.23 
 
 		 1114 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  25.74 
 
 		 1004 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  22.11 
 
 		 1053 aa  138  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.45 
 
 		 1226 aa  136  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.04 
 
 		 1276 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  22.02 
 
 		 1070 aa  134  9e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  20.56 
 
 		 1316 aa  132  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  20.8 
 
 		 1070 aa  131  6e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  21.87 
 
 		 1374 aa  130  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  22.42 
 
 		 1400 aa  129  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  20.63 
 
 		 1378 aa  129  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  20.58 
 
 		 1340 aa  129  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  21.73 
 
 		 1327 aa  128  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  24.19 
 
 		 1175 aa  127  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  23.05 
 
 		 1313 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  22.61 
 
 		 1355 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4291  histidine kinase  21.7 
 
 		 954 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.608548  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3101  histidine kinase  22.77 
 
 		 1037 aa  125  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377571  normal  0.147743 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  20.13 
 
 		 1063 aa  124  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0341  sensory box protein  23.17 
 
 		 1515 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  21.14 
 
 		 1034 aa  122  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  22.03 
 
 		 1388 aa  122  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.45 
 
 		 1237 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  23.12 
 
 		 1185 aa  120  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  22.09 
 
 		 1404 aa  120  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  23.05 
 
 		 1418 aa  119  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  20.56 
 
 		 1347 aa  116  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  23.54 
 
 		 1250 aa  116  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  34 
 
 		 1033 aa  114  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  21.42 
 
 		 1084 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  25.82 
 
 		 1048 aa  112  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  21.39 
 
 		 1093 aa  110  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  21.75 
 
 		 1344 aa  109  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  21.26 
 
 		 1118 aa  108  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  22.33 
 
 		 1086 aa  108  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3424  GGDEF domain-containing protein  20.96 
 
 		 1502 aa  107  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  22.15 
 
 		 1396 aa  106  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1400  signal transduction histidine kinase, LytS  22.52 
 
 		 1051 aa  107  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3950  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.2 
 
 		 1508 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  31.73 
 
 		 397 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  22.24 
 
 		 1046 aa  105  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  21.48 
 
 		 1351 aa  105  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 742 aa  105  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  25.11 
 
 		 1031 aa  104  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4026  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  22.78 
 
 		 1508 aa  104  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  23.4 
 
 		 1344 aa  103  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  23.18 
 
 		 1181 aa  103  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  24.45 
 
 		 1311 aa  103  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  22.67 
 
 		 1349 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  21.2 
 
 		 1384 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  19.78 
 
 		 1278 aa  102  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.24 
 
 		 1242 aa  101  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4145  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  22.02 
 
 		 1508 aa  101  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05925  GGDEF domain protein  24.78 
 
 		 1005 aa  101  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  19.6 
 
 		 1373 aa  101  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  22.89 
 
 		 1374 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  22.7 
 
 		 1194 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 344 aa  100  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  19.98 
 
 		 1366 aa  100  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3633  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.06 
 
 		 1504 aa  99.4  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0311  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.06 
 
 		 1504 aa  99.8  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 725 aa  98.6  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.25 
 
 		 1505 aa  98.2  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 517 aa  98.2  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0725  histidine kinase  23.76 
 
 		 1036 aa  97.4  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>