More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01090 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  100 
 
 		 385 aa  752    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  54.16 
 
 		 372 aa  328  8e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 567 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.05 
 
 		 566 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 544 aa  192  8e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  37.43 
 
 		 591 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  37.53 
 
 		 572 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  35.36 
 
 		 543 aa  176  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 571 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  35 
 
 		 573 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 409 aa  157  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 573 aa  157  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 543 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 590 aa  154  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  32.83 
 
 		 391 aa  153  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 568 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 566 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  33.51 
 
 		 401 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 595 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 559 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 565 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 578 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  33.33 
 
 		 577 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 631 aa  132  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 568 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 568 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 566 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 566 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 566 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 568 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 579 aa  126  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 571 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 556 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 535 aa  122  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 535 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 525 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 575 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  34.57 
 
 		 536 aa  117  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 580 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  31.68 
 
 		 578 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 568 aa  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 550 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 592 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 456 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 381 aa  106  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 588 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  33.07 
 
 		 573 aa  103  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  30.8 
 
 		 549 aa  100  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  28.97 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2567  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.5 
 
 		 623 aa  99.8  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2261  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.8 
 
 		 602 aa  97.4  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0999245  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23240  histidine kinase with GAF domain protein  27.6 
 
 		 635 aa  96.3  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 574 aa  95.5  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 344 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  34.93 
 
 		 484 aa  94  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 		 421 aa  92.8  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 392 aa  92.8  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 545 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01200  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarL  29.62 
 
 		 598 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2424  histidine kinase  29.62 
 
 		 598 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0527369  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38430  PAS domain S-box  30 
 
 		 552 aa  90.1  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01210  hypothetical protein  29.62 
 
 		 598 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.678292  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1331  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.62 
 
 		 598 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.150699  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1372  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.62 
 
 		 598 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.497152  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2401  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.62 
 
 		 598 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1918  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.62 
 
 		 598 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184147  normal  0.168413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1705  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.62 
 
 		 598 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.55706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1389  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.65 
 
 		 598 aa  89.4  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0922186  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 618 aa  89.4  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1423  sensor histidine kinase VraS  31.16 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2317  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.91 
 
 		 598 aa  89.4  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1849  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.83 
 
 		 603 aa  89  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 464 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 545 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 396 aa  87  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.693223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2899  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.37 
 
 		 594 aa  87  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1952  two-component sensor NarX  27.34 
 
 		 591 aa  87  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.107015  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 372 aa  86.7  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4655  putative PAS/PAC sensor protein  34.98 
 
 		 535 aa  87  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2522  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.57 
 
 		 380 aa  86.7  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 424 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2123  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.57 
 
 		 593 aa  86.7  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2232  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.57 
 
 		 593 aa  86.7  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1767  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.66 
 
 		 604 aa  86.3  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 665 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0022  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 487 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2631  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 655 aa  85.9  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 638 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  31.64 
 
 		 673 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  29.13 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 682 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1973  histidine kinase  31.05 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0289  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  28.78 
 
 		 474 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  29.13 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 564 aa  84.3  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  29.13 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0693  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 474 aa  84.3  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1939  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2369  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.78 
 
 		 563 aa  83.6  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>