More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3765 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4599  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  77.62 
 
 
637 aa  937    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
638 aa  1288    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0423  GAF sensor signal transduction histidine kinase  52.24 
 
 
638 aa  623  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0432  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  52.55 
 
 
638 aa  622  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1870  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  49.28 
 
 
636 aa  615  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1105  GAF sensor signal transduction histidine kinase  53.07 
 
 
632 aa  610  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.097468  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6191  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.29 
 
 
627 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0297171 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1687  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  49.92 
 
 
643 aa  549  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2631  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 
655 aa  437  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3597  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 
651 aa  425  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.495482  normal  0.378972 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4674  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 
651 aa  425  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681088  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0979  putative transmembrane nitrate/nitrite sensor kinase transcription regulator protein  38.07 
 
 
637 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0833  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  37.89 
 
 
646 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0228489 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5065  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.77 
 
 
675 aa  398  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1735  nitrate/nitrite sensory protein NarX, putative  37.94 
 
 
640 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2763  putative nitrate/nitrite sensor protein  37.94 
 
 
644 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.14936  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2685  nitrate/nitrite sensor protein NarX  37.94 
 
 
644 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2629  nitrate/nitrite sensor protein NarX  37.94 
 
 
644 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189508  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1518  nitrate/nitrite sensor protein NarX  37.94 
 
 
640 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.233723  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3073  nitrate/nitrite sensor protein NarX  37.94 
 
 
640 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2245  nitrate/nitrite sensor protein NarX  37.94 
 
 
640 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.482228  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2086  signal transduction histidine kinase NarQ  37.88 
 
 
671 aa  389  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1850  nitrate/nitrite sensory protein NarX, putative  37.04 
 
 
644 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2369  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  28.75 
 
 
563 aa  196  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 
618 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1400  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
644 aa  189  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.324076  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1005  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  27.44 
 
 
644 aa  188  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3690  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.75 
 
 
566 aa  187  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02360  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarP (NarL)  27.59 
 
 
566 aa  187  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.161159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1208  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.59 
 
 
566 aa  187  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02322  hypothetical protein  27.59 
 
 
566 aa  187  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.147876  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2598  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.59 
 
 
566 aa  187  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1201  histidine kinase  27.59 
 
 
566 aa  186  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2615  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.43 
 
 
566 aa  185  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.538567  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2838  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.59 
 
 
566 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2748  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.59 
 
 
566 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.560652  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 
550 aa  181  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2567  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.81 
 
 
623 aa  179  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2261  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.81 
 
 
602 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0999245  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000510  nitrate/nitrite sensor protein  27.72 
 
 
578 aa  171  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0971  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.11 
 
 
567 aa  169  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.630053  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4013  histidine kinase  29.06 
 
 
637 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03848  Signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific  26.44 
 
 
588 aa  168  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13740  two-component sensor NarX  28.75 
 
 
622 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.869934  normal  0.455278 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2899  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.32 
 
 
594 aa  167  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2712  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.19 
 
 
572 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1230  two-component sensor NarX  28.57 
 
 
622 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1849  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.19 
 
 
603 aa  164  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2407  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27 
 
 
572 aa  163  9e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2300  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.49 
 
 
589 aa  163  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.258904 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0930  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  26.47 
 
 
567 aa  160  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000296832  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2224  nitrate/nitrite sensor protein NarX  25.82 
 
 
589 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129909  normal  0.0788983 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0603  signal transduction histidine kinase sensor  24.02 
 
 
707 aa  158  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0220625  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2123  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.9 
 
 
593 aa  157  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1767  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.23 
 
 
604 aa  158  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2232  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.9 
 
 
593 aa  157  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2964  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  26.26 
 
 
564 aa  155  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.551015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2317  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.56 
 
 
598 aa  155  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0843  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.85 
 
 
567 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00390352  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0621  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  26.09 
 
 
571 aa  154  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000745015  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2463  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
415 aa  152  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0614  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.24 
 
 
583 aa  150  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.797988  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0830  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  24.06 
 
 
570 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00637063  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
464 aa  147  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
456 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1670  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  30.59 
 
 
446 aa  141  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1389  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.73 
 
 
598 aa  140  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0922186  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01200  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarL  26.16 
 
 
598 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2424  histidine kinase  26.16 
 
 
598 aa  137  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0527369  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2401  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.16 
 
 
598 aa  137  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01210  hypothetical protein  26.16 
 
 
598 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.678292  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1705  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.16 
 
 
598 aa  137  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.55706  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1372  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.16 
 
 
598 aa  137  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.497152  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1918  nitrate/nitrite sensor protein NarX  25.49 
 
 
598 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184147  normal  0.168413 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1331  nitrate/nitrite sensor protein NarX  25.99 
 
 
598 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.150699  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3981  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  25.13 
 
 
585 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1374  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.15 
 
 
613 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1897  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.15 
 
 
598 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.149462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1961  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.15 
 
 
598 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.68817 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1557  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.15 
 
 
598 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0417714 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1902  nitrate/nitrite sensor protein NarX  25.49 
 
 
598 aa  132  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 
692 aa  126  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
463 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
469 aa  125  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2636  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
583 aa  124  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761488  normal  0.0281081 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  27.31 
 
 
462 aa  120  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1964  histidine kinase  28.79 
 
 
475 aa  120  7.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05380  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  35.68 
 
 
562 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1952  two-component sensor NarX  33.92 
 
 
591 aa  118  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.107015  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
725 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
508 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0647  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  31.46 
 
 
570 aa  115  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.469097  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.91 
 
 
1648 aa  114  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0684  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  24.03 
 
 
600 aa  114  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000102033  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2673  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.3 
 
 
566 aa  114  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2624  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.3 
 
 
566 aa  114  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2713  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.3 
 
 
566 aa  114  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.774679 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2846  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.3 
 
 
566 aa  114  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  32.21 
 
 
430 aa  114  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2739  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.3 
 
 
566 aa  114  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>