More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2549 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
456 aa  898    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.89 
 
 
464 aa  405  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.99 
 
 
1648 aa  230  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 
373 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.66 
 
 
421 aa  219  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  37.37 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 
392 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 
393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 
386 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
381 aa  177  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  51.48 
 
 
571 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  52.63 
 
 
573 aa  163  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0833  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  30.98 
 
 
646 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0228489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  42.06 
 
 
536 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  53.5 
 
 
595 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  50.88 
 
 
573 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  43.56 
 
 
549 aa  152  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  47.8 
 
 
565 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  49.38 
 
 
577 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
545 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  48.12 
 
 
572 aa  150  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.62 
 
 
568 aa  146  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  31.77 
 
 
529 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  30.54 
 
 
462 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
544 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 
725 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.57 
 
 
580 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2631  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
655 aa  144  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
545 aa  143  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
548 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.38 
 
 
567 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1687  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  32.06 
 
 
643 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0423  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
638 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  46.11 
 
 
573 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1870  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  32.65 
 
 
636 aa  140  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 
566 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1308  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
381 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000110665  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3597  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
651 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.495482  normal  0.378972 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4674  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
651 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681088  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
588 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.45 
 
 
535 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 
550 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
592 aa  136  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 
508 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 
575 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
638 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0432  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  34.93 
 
 
638 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6191  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 
627 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0297171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.29 
 
 
559 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 
579 aa  134  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
665 aa  133  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0979  putative transmembrane nitrate/nitrite sensor kinase transcription regulator protein  29.07 
 
 
637 aa  132  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  50.32 
 
 
591 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  47.2 
 
 
568 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.2 
 
 
568 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.2 
 
 
568 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
469 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1850  nitrate/nitrite sensory protein NarX, putative  28.17 
 
 
644 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  43.68 
 
 
556 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 
574 aa  129  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2763  putative nitrate/nitrite sensor protein  27.48 
 
 
644 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.14936  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 
566 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 
566 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2685  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.48 
 
 
644 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 
566 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2629  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.48 
 
 
644 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189508  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  42.94 
 
 
578 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1735  nitrate/nitrite sensory protein NarX, putative  27.91 
 
 
640 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
463 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1518  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.91 
 
 
640 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.233723  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2245  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.91 
 
 
640 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.482228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3073  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.91 
 
 
640 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1105  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
632 aa  127  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.097468  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4599  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  33.9 
 
 
637 aa  127  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2463  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 
415 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
578 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
568 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0614  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.88 
 
 
583 aa  124  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.797988  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
352 aa  123  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
584 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 
779 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  36.19 
 
 
392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
591 aa  120  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
552 aa  119  7.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.15 
 
 
566 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
517 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0939  histidine kinase  38.39 
 
 
363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 
391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
610 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  31.86 
 
 
391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5065  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.27 
 
 
675 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446679  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13740  two-component sensor NarX  32.21 
 
 
622 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.869934  normal  0.455278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
591 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
546 aa  113  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
775 aa  113  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1345  histidine kinase  35.61 
 
 
338 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000383255 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 
543 aa  111  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
801 aa  111  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
442 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>