More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1296 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
386 aa  743    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.64 
 
 
456 aa  207  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 
421 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 
393 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
392 aa  189  9e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  38.61 
 
 
373 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
381 aa  165  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  54.43 
 
 
536 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 
373 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  50 
 
 
592 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  40.94 
 
 
577 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.43 
 
 
573 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.07 
 
 
580 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  49.43 
 
 
573 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.16 
 
 
571 aa  143  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
490 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  52.23 
 
 
565 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.49 
 
 
595 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.43 
 
 
566 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4975  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.22 
 
 
326 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  0.286418 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  49.7 
 
 
556 aa  135  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.36 
 
 
568 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 
588 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
561 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.11 
 
 
535 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.94 
 
 
566 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.94 
 
 
566 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.94 
 
 
566 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  44.61 
 
 
485 aa  129  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  45.45 
 
 
573 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  42.05 
 
 
572 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  41.78 
 
 
640 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
464 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
545 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 
535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  43.53 
 
 
549 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 
359 aa  127  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  51.59 
 
 
568 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  51.59 
 
 
568 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  51.59 
 
 
568 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 
543 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
559 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1874  histidine kinase  42.11 
 
 
293 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1238  histidine kinase  40.38 
 
 
377 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
548 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.02 
 
 
567 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  36.99 
 
 
489 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  37.62 
 
 
381 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  40 
 
 
497 aa  123  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
725 aa  122  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 
575 aa  122  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 
568 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  39.34 
 
 
662 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  49.61 
 
 
578 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 
662 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  39.29 
 
 
1226 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
352 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.99 
 
 
521 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
775 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  46.02 
 
 
591 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1744  histidine kinase  31.13 
 
 
399 aa  120  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.376505  normal  0.0197179 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  39.29 
 
 
1101 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  38.21 
 
 
772 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
591 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
658 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
1229 aa  120  6e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  38.32 
 
 
515 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 
564 aa  119  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  38.99 
 
 
575 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  38.99 
 
 
575 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  34.95 
 
 
379 aa  119  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
381 aa  119  9e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
401 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2416  histidine kinase  34.1 
 
 
344 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  38.99 
 
 
575 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 
517 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
591 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2464  ATPase domain-containing protein  34.1 
 
 
344 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
552 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
401 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
401 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  38.14 
 
 
783 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  32.2 
 
 
388 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  38.99 
 
 
740 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4453  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 
376 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  35.91 
 
 
466 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4063  histidine kinase  37.68 
 
 
249 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  37.79 
 
 
381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
544 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  37.79 
 
 
381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
478 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 
339 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 
700 aa  116  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0188  histidine kinase  30.73 
 
 
693 aa  116  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
771 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  37.74 
 
 
403 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  39.22 
 
 
501 aa  115  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2405  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90978  normal  0.0505439 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 
748 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
770 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>