More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1055 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 401 aa  791    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 401 aa  791    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  84.71 
 
 		 403 aa  642    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  99 
 
 		 401 aa  784    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  84.38 
 
 		 399 aa  657    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  38.96 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0181  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 388 aa  210  4e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.610235  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2131  sensor histidine kinase  40.43 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1941  sensor histidine kinase  36.97 
 
 		 394 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.91 
 
 		 640 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 748 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  35.24 
 
 		 391 aa  129  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  38.59 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  38.59 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 725 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4182  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 389 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 658 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  35.29 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 447 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 394 aa  121  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 545 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  38.72 
 
 		 489 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 545 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  35 
 
 		 387 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 662 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 779 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3668  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 650 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 770 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  35.86 
 
 		 662 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 535 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 561 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1122  histidine kinase  34.22 
 
 		 357 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  0.812788 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 471 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 469 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  38.82 
 
 		 481 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  34.88 
 
 		 391 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  40.28 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3762  histidine kinase  35.27 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011366  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 548 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5386  two component sensor kinase  34.35 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  34.2 
 
 		 482 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  36.99 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 544 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  37.05 
 
 		 640 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 480 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 480 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  36.73 
 
 		 460 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 461 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  39.92 
 
 		 687 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  34.96 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2326  histidine kinase  35.91 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4745  Histidine kinase  35.39 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  34.96 
 
 		 351 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 475 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 478 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  33.62 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  34.07 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 486 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  34.07 
 
 		 351 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  34.07 
 
 		 351 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  34.07 
 
 		 351 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  34.07 
 
 		 351 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  34.07 
 
 		 351 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 521 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  34.07 
 
 		 351 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1913  histidine kinase  35.65 
 
 		 353 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000343654  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  34.07 
 
 		 351 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  39.52 
 
 		 485 aa  110  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  32.39 
 
 		 287 aa  110  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  34.42 
 
 		 379 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  34.33 
 
 		 431 aa  109  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  33.04 
 
 		 381 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 459 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.783946 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 459 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  31.03 
 
 		 585 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  34.68 
 
 		 497 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  32.72 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  34.07 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  37.96 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  38.04 
 
 		 686 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01475  histidine kinase sensor protein  31.3 
 
 		 668 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399099  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 624 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  33.21 
 
 		 518 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 490 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  32.13 
 
 		 451 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 552 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  30.52 
 
 		 451 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 474 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  33.05 
 
 		 456 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 468 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>