More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1874 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1874  histidine kinase  100 
 
 		 293 aa  585  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.24 
 
 		 468 aa  269  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3863  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.3 
 
 		 446 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.165954  normal  0.826823 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2903  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  50.89 
 
 		 459 aa  256  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.3 
 
 		 447 aa  255  7e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  54.3 
 
 		 447 aa  255  8e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0921  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.64 
 
 		 446 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  52.45 
 
 		 461 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.96 
 
 		 446 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0766  histidine kinase  51.98 
 
 		 464 aa  238  8e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.701174  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4109  histidine kinase  51.52 
 
 		 439 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  42.13 
 
 		 464 aa  162  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2235  histidine kinase  42.98 
 
 		 457 aa  161  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 494 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  37.1 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1456  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 489 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.249637 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 485 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 514 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0289  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  36.96 
 
 		 474 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0123  sensor histidine kinase  40.27 
 
 		 466 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  35.85 
 
 		 461 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  37.44 
 
 		 683 aa  142  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3495  signal transduction histidine kinase-like protein  36.59 
 
 		 410 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0736574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  37.96 
 
 		 575 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  37.55 
 
 		 575 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  37.55 
 
 		 575 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 		 541 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  38.02 
 
 		 740 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 370 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 692 aa  132  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 470 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.510895  normal  0.956112 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 470 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 541 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 748 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 386 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  37.55 
 
 		 619 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  37.55 
 
 		 680 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 703 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 490 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 553 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  35.32 
 
 		 373 aa  123  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 594 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  37.13 
 
 		 680 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  40 
 
 		 381 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 801 aa  122  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  37.71 
 
 		 356 aa  122  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 363 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 462 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 462 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  38.68 
 
 		 456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  35.14 
 
 		 799 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  36.33 
 
 		 687 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 366 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  35.43 
 
 		 797 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  36.1 
 
 		 1101 aa  118  9e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  33.75 
 
 		 598 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 598 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  34.33 
 
 		 492 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 492 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  34.33 
 
 		 463 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  32.02 
 
 		 515 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  34.33 
 
 		 463 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  34.33 
 
 		 492 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  34.33 
 
 		 492 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  34.33 
 
 		 492 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 795 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 573 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  34.7 
 
 		 640 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 526 aa  116  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 665 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 1229 aa  115  6e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 448 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 799 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  37.61 
 
 		 1809 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  36.28 
 
 		 1226 aa  115  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  35.65 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0179  histidine kinase  37.5 
 
 		 418 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4515  two-component regulatory system sensory histidine kinase  35 
 
 		 383 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0377261  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4381  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  33.76 
 
 		 463 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 535 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  33.65 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 596 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  34.36 
 
 		 325 aa  113  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 671 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 795 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  37.8 
 
 		 447 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 795 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 546 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  35.38 
 
 		 645 aa  112  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0848  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 363 aa  112  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 1168 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  32.74 
 
 		 795 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17340  intracellular sensory histidine protein kinase, two component  36.16 
 
 		 356 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 521 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 564 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 595 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 684 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>