More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0766 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0766  histidine kinase  100 
 
 
464 aa  935    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.701174  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0921  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.71 
 
 
446 aa  484  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.19 
 
 
446 aa  474  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3863  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.2 
 
 
446 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.165954  normal  0.826823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  53.44 
 
 
461 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.24 
 
 
468 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  54.89 
 
 
447 aa  444  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.89 
 
 
447 aa  444  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4109  histidine kinase  52.18 
 
 
439 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2903  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  45.15 
 
 
459 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419301  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1874  histidine kinase  51.98 
 
 
293 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  35.27 
 
 
485 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0289  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  36.32 
 
 
474 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  36.46 
 
 
461 aa  213  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  37.25 
 
 
464 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0123  sensor histidine kinase  33.56 
 
 
466 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 
494 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1456  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
489 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.249637 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2235  histidine kinase  47.93 
 
 
457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 
514 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  40.38 
 
 
373 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 
470 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.510895  normal  0.956112 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 
470 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  38.14 
 
 
740 aa  137  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
462 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
462 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  37.72 
 
 
575 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
692 aa  134  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  37.72 
 
 
575 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  37.72 
 
 
575 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
450 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
671 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
490 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 
412 aa  131  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
489 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
541 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
1168 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  38.21 
 
 
619 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
700 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
596 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
395 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  38.21 
 
 
680 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  36.24 
 
 
680 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  34.58 
 
 
687 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
526 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
541 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  36.63 
 
 
515 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 
707 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 
684 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  35.98 
 
 
598 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
553 aa  127  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
703 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
598 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
703 aa  126  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  32.76 
 
 
683 aa  126  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2159  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
439 aa  126  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0525823 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 
448 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
700 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
700 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
665 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
546 aa  125  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
594 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
366 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
595 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0848  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
363 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  34.5 
 
 
458 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0754  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.961024  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3495  signal transduction histidine kinase-like protein  35.89 
 
 
410 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0736574  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
748 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  39.6 
 
 
466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  35.41 
 
 
799 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
480 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  36.73 
 
 
1809 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
478 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0564  putative signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
383 aa  120  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
447 aa  119  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  26.79 
 
 
483 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4297  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 
347 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  38.46 
 
 
456 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  38.5 
 
 
458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  36.62 
 
 
671 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  37.44 
 
 
670 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
410 aa  118  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  37.5 
 
 
1226 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 
385 aa  117  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
1229 aa  117  6e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  34.93 
 
 
797 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0179  histidine kinase  31.18 
 
 
418 aa  116  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
795 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  30.43 
 
 
493 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
485 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1596  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430448 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1668  histidine kinase  39.64 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
298 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
795 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1988  putative signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
479 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00146198  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>