More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0142 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0289  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  90.44 
 
 		 474 aa  858    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 485 aa  968    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  98.97 
 
 		 485 aa  960    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0123  sensor histidine kinase  63.91 
 
 		 466 aa  580  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  64.25 
 
 		 461 aa  578  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 		 447 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  40.52 
 
 		 447 aa  281  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  38.5 
 
 		 461 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3863  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.165954  normal  0.826823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 468 aa  266  5.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0921  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 446 aa  263  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 514 aa  256  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 446 aa  254  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1456  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 489 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.249637 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 		 494 aa  249  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2903  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  37.95 
 
 		 459 aa  246  8e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4109  histidine kinase  36.75 
 
 		 439 aa  223  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0766  histidine kinase  35.27 
 
 		 464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.701174  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2235  histidine kinase  33.33 
 
 		 457 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 470 aa  186  7e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.510895  normal  0.956112 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 470 aa  186  7e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  34.8 
 
 		 464 aa  178  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 		 541 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1874  histidine kinase  37.1 
 
 		 293 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  40.4 
 
 		 619 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  40.4 
 
 		 680 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  40.4 
 
 		 680 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  35.8 
 
 		 683 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 703 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  39.37 
 
 		 687 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 		 541 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 1168 aa  146  9e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 665 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 700 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 700 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 684 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 707 aa  140  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 703 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 		 700 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 		 448 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 450 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 553 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0582  signal transduction histidine kinase-like protein  39.04 
 
 		 394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  37.44 
 
 		 795 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 595 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 795 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4381  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 372 aa  134  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 		 489 aa  134  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  38.59 
 
 		 515 aa  133  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 671 aa  133  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4297  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 		 347 aa  133  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 598 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 594 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 692 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 596 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  33.33 
 
 		 598 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 801 aa  131  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  36.71 
 
 		 373 aa  130  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 799 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  36.77 
 
 		 671 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 490 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  35.65 
 
 		 1809 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 		 370 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 748 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  37.38 
 
 		 797 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 546 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  37.85 
 
 		 799 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0754  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 384 aa  126  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.961024  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  37.34 
 
 		 492 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  37.34 
 
 		 492 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 359 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  37.34 
 
 		 492 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  37.34 
 
 		 492 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 492 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  34.43 
 
 		 1046 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 748 aa  126  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 795 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  37.34 
 
 		 463 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 795 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  37.34 
 
 		 463 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3495  signal transduction histidine kinase-like protein  34.64 
 
 		 410 aa  126  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0736574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  34.77 
 
 		 325 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 526 aa  124  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0902  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 509 aa  124  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  32 
 
 		 381 aa  123  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  32 
 
 		 381 aa  123  6e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  35.95 
 
 		 489 aa  123  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1596  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 385 aa  123  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430448 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  35.87 
 
 		 670 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0564  putative signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  37.21 
 
 		 493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  36.4 
 
 		 463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 573 aa  121  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4515  two-component regulatory system sensory histidine kinase  38.63 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0377261  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 		 363 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 552 aa  120  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  35.86 
 
 		 518 aa  119  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 412 aa  119  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>