More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0994 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  100 
 
 		 577 aa  1135    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  50.27 
 
 		 573 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.2 
 
 		 573 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.98 
 
 		 571 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  44.96 
 
 		 572 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  46.14 
 
 		 591 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.83 
 
 		 566 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.7 
 
 		 567 aa  392  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 		 568 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.49 
 
 		 566 aa  369  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 		 535 aa  362  9e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  45.97 
 
 		 536 aa  362  1e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  42.78 
 
 		 565 aa  359  8e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 		 566 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 		 566 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 		 566 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 		 595 aa  339  9e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 		 592 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 		 559 aa  334  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 		 580 aa  332  9e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 		 588 aa  332  1e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 		 568 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 		 568 aa  329  9e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 		 568 aa  329  9e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 578 aa  327  4.0000000000000003e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 		 556 aa  322  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 		 579 aa  317  4e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 		 544 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  40.14 
 
 		 573 aa  298  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  37.17 
 
 		 549 aa  296  6e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  39.32 
 
 		 578 aa  294  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.24 
 
 		 575 aa  292  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 		 525 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 543 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 631 aa  282  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 535 aa  276  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 568 aa  266  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.85 
 
 		 590 aa  239  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  34.66 
 
 		 543 aa  237  6e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 571 aa  221  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 550 aa  178  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23240  histidine kinase with GAF domain protein  30.62 
 
 		 635 aa  168  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  52.91 
 
 		 392 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  37.11 
 
 		 401 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.38 
 
 		 456 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  32.74 
 
 		 391 aa  147  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 		 386 aa  146  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 409 aa  143  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.83 
 
 		 381 aa  140  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 		 372 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  38.52 
 
 		 673 aa  125  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  38.86 
 
 		 385 aa  124  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4209  putative PAS/PAC sensor protein  35.16 
 
 		 795 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.05 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 574 aa  107  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  38.95 
 
 		 373 aa  107  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 		 421 aa  106  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  37.71 
 
 		 484 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  32.54 
 
 		 851 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4655  putative PAS/PAC sensor protein  41.94 
 
 		 535 aa  101  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 373 aa  97.1  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 552 aa  95.5  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 345 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18330  histidine kinase  32.85 
 
 		 382 aa  95.1  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0022  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 487 aa  94.7  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  34.09 
 
 		 828 aa  94  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  34.09 
 
 		 529 aa  93.6  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1849  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.43 
 
 		 603 aa  90.9  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 709 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 544 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 545 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 725 aa  89.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 517 aa  87.4  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2261  nitrate/nitrite sensor protein NarX  31.98 
 
 		 602 aa  87.4  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0999245  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 463 aa  87  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2567  nitrate/nitrite sensor protein NarX  31.98 
 
 		 623 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 545 aa  85.1  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2232  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.82 
 
 		 593 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 		 464 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2123  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.82 
 
 		 593 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2522  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.28 
 
 		 380 aa  82.8  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2899  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.16 
 
 		 594 aa  82.4  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.693223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 652 aa  81.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1142  Signal transduction histidine kinase  23.57 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 638 aa  81.3  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0693  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 474 aa  80.5  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1767  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.18 
 
 		 604 aa  80.5  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 682 aa  80.1  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 662 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0444  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  32.4 
 
 		 603 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1389  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.45 
 
 		 598 aa  80.1  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0922186  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38430  PAS domain S-box  28.85 
 
 		 552 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  31.28 
 
 		 662 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 1168 aa  78.6  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 658 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1372  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.45 
 
 		 598 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.497152  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1705  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.45 
 
 		 598 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.55706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2401  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.45 
 
 		 598 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>