More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4125 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  66.26 
 
 		 566 aa  684    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 568 aa  1113    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  66.26 
 
 		 566 aa  684    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 568 aa  1113    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  69.6 
 
 		 559 aa  722    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  65.06 
 
 		 578 aa  651    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  66.78 
 
 		 573 aa  658    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  66.26 
 
 		 566 aa  684    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  99.65 
 
 		 568 aa  1106    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  68.1 
 
 		 575 aa  662    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.16 
 
 		 595 aa  475  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.05 
 
 		 566 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  43.04 
 
 		 572 aa  399  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 578 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.89 
 
 		 568 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 		 571 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.62 
 
 		 580 aa  364  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  42.66 
 
 		 591 aa  360  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.64 
 
 		 567 aa  360  3e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  43.77 
 
 		 573 aa  354  2.9999999999999997e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  43.86 
 
 		 588 aa  350  3e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.61 
 
 		 566 aa  343  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.06 
 
 		 573 aa  342  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 		 592 aa  340  4e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  40.55 
 
 		 577 aa  335  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 568 aa  334  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  40.84 
 
 		 549 aa  330  6e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 		 579 aa  315  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 565 aa  314  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 		 556 aa  301  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  40.82 
 
 		 536 aa  298  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  39.39 
 
 		 543 aa  298  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 		 543 aa  293  5e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 544 aa  291  3e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.4 
 
 		 631 aa  271  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 535 aa  270  4e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23240  histidine kinase with GAF domain protein  34.96 
 
 		 635 aa  224  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 535 aa  223  8e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 590 aa  222  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 525 aa  209  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 571 aa  201  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  51.23 
 
 		 392 aa  172  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.52 
 
 		 381 aa  160  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.29 
 
 		 456 aa  148  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 550 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  35.28 
 
 		 828 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  33.33 
 
 		 851 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 		 386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  33.08 
 
 		 391 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  35.23 
 
 		 401 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  37.15 
 
 		 385 aa  126  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  42.69 
 
 		 373 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 393 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.11 
 
 		 421 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.83 
 
 		 373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 372 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  31.01 
 
 		 673 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4655  putative PAS/PAC sensor protein  35.43 
 
 		 535 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 665 aa  100  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  35.42 
 
 		 484 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  24.71 
 
 		 523 aa  92  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4209  putative PAS/PAC sensor protein  32.38 
 
 		 795 aa  90.1  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 523 aa  90.1  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2292  sensor histidine kinase  28.63 
 
 		 365 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 		 464 aa  87.8  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5592  sensor histidine kinase  24.69 
 
 		 523 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5507  sensor histidine kinase  23.67 
 
 		 523 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  27.64 
 
 		 372 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  27.64 
 
 		 372 aa  87  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  27.64 
 
 		 365 aa  87  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2522  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.51 
 
 		 380 aa  87  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5416  sensor histidine kinase  24.34 
 
 		 516 aa  87  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 345 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  27.64 
 
 		 372 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  28.83 
 
 		 547 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5092  two-component sensor protein  23.43 
 
 		 523 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2232  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.1 
 
 		 593 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2123  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.1 
 
 		 593 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2374  sensor histidine kinase  27.64 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0968027  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 725 aa  85.5  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5541  sensor histidine kinase, putative  24.21 
 
 		 523 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2045  sensor histidine kinase  27.24 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5109  sensor histidine kinase  23.61 
 
 		 523 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18330  histidine kinase  33.65 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 489 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1201  histidine kinase  32.7 
 
 		 566 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02360  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarP (NarL)  32.23 
 
 		 566 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.161159  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1389  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.34 
 
 		 598 aa  78.6  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0922186  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2598  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.23 
 
 		 566 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02322  hypothetical protein  32.23 
 
 		 566 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.147876  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2748  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.23 
 
 		 566 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.560652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1208  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.23 
 
 		 566 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2615  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.23 
 
 		 566 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.538567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3690  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.23 
 
 		 566 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01200  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarL  27.34 
 
 		 598 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01210  hypothetical protein  27.34 
 
 		 598 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.678292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2401  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.34 
 
 		 598 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1918  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.34 
 
 		 598 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184147  normal  0.168413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>