More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4980 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 631 aa  1208    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  63.37 
 
 		 579 aa  588  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  43.23 
 
 		 572 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.31 
 
 		 568 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  44.56 
 
 		 591 aa  363  5.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 		 567 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.19 
 
 		 566 aa  346  8.999999999999999e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 571 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  43.08 
 
 		 573 aa  333  5e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 		 573 aa  323  6e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  43.68 
 
 		 588 aa  314  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 		 580 aa  308  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 		 566 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  39.86 
 
 		 577 aa  291  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 592 aa  290  4e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 		 565 aa  288  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.63 
 
 		 595 aa  286  5.999999999999999e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 544 aa  278  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 		 568 aa  273  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 		 568 aa  273  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 		 568 aa  269  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.9 
 
 		 559 aa  267  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 556 aa  266  7e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 		 525 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 535 aa  249  8e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 566 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 566 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 566 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  37.63 
 
 		 578 aa  243  7.999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 578 aa  240  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 543 aa  239  9e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  36.14 
 
 		 543 aa  228  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 535 aa  226  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 590 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 575 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  37.15 
 
 		 573 aa  221  5e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 568 aa  206  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 571 aa  199  9e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  36.8 
 
 		 401 aa  193  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  47.3 
 
 		 536 aa  171  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.39 
 
 		 550 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  32.3 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 409 aa  153  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23240  histidine kinase with GAF domain protein  29.41 
 
 		 635 aa  150  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  36.2 
 
 		 673 aa  150  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4209  putative PAS/PAC sensor protein  38.11 
 
 		 795 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 		 392 aa  140  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  30.79 
 
 		 385 aa  138  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  41.74 
 
 		 549 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 		 372 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 		 381 aa  123  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4655  putative PAS/PAC sensor protein  37.17 
 
 		 535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 456 aa  111  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 725 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5541  sensor histidine kinase, putative  25.11 
 
 		 523 aa  103  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5592  sensor histidine kinase  24.67 
 
 		 523 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  35.96 
 
 		 484 aa  101  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5109  sensor histidine kinase  23.57 
 
 		 523 aa  99  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.79 
 
 		 523 aa  97.8  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5416  sensor histidine kinase  23.23 
 
 		 516 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5092  two-component sensor protein  23.35 
 
 		 523 aa  96.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5507  sensor histidine kinase  23.35 
 
 		 523 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 464 aa  94.4  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 421 aa  92.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 545 aa  91.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38430  PAS domain S-box  30.19 
 
 		 552 aa  90.5  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4486  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 582 aa  90.5  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  29.54 
 
 		 547 aa  89  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 665 aa  88.6  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 352 aa  88.6  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  22.69 
 
 		 523 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  30.14 
 
 		 851 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1902  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.6 
 
 		 598 aa  84.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2522  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.62 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2123  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.62 
 
 		 593 aa  83.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2232  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.62 
 
 		 593 aa  83.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1687  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  30.57 
 
 		 643 aa  83.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2317  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.39 
 
 		 598 aa  83.2  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 393 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0022  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 487 aa  83.2  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1374  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.25 
 
 		 613 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1961  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.25 
 
 		 598 aa  81.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.68817 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1557  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.25 
 
 		 598 aa  81.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0417714 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1897  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.25 
 
 		 598 aa  81.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.149462 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 742 aa  81.3  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18330  histidine kinase  32.7 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  29.49 
 
 		 828 aa  81.3  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4870  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 566 aa  80.9  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125677  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2899  nitrate/nitrite sensor protein NarX  33.07 
 
 		 594 aa  80.9  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 605 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 682 aa  80.5  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2631  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 655 aa  80.5  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1670  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  29.35 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 404 aa  80.1  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4013  histidine kinase  29.92 
 
 		 637 aa  80.5  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  33.18 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 391 aa  79.7  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  30.48 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  28.71 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>