More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4486 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4486  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
582 aa  1180    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  31.96 
 
 
373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
725 aa  143  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
421 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 
665 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
682 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  30.74 
 
 
547 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
546 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5092  two-component sensor protein  26.27 
 
 
523 aa  121  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5507  sensor histidine kinase  26.05 
 
 
523 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
564 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
574 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5592  sensor histidine kinase  25.44 
 
 
523 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
508 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5109  sensor histidine kinase  25.49 
 
 
523 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
775 aa  117  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5416  sensor histidine kinase  24.35 
 
 
516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5541  sensor histidine kinase, putative  33.62 
 
 
523 aa  114  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  31.97 
 
 
523 aa  114  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
523 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
682 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
372 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
370 aa  110  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  30.07 
 
 
377 aa  108  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
584 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5264  two-component sensor protein, C-terminus  34.5 
 
 
193 aa  108  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3079  sensor histidine kinase  31.79 
 
 
372 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000507367 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 
412 aa  107  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  30.6 
 
 
372 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  30.6 
 
 
372 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  30.6 
 
 
372 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2244  sensor histidine kinase  31.43 
 
 
372 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  30.6 
 
 
365 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2292  sensor histidine kinase  30.6 
 
 
365 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2374  sensor histidine kinase  30.96 
 
 
372 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0968027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2045  sensor histidine kinase  30.25 
 
 
372 aa  103  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 
373 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  29.84 
 
 
392 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2463  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
415 aa  101  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1903  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 
370 aa  100  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000111521  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1937  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  27.39 
 
 
370 aa  100  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000507079  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.66 
 
 
591 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
332 aa  99.4  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38430  PAS domain S-box  30.3 
 
 
552 aa  99.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  35.16 
 
 
397 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  30.73 
 
 
351 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
411 aa  96.3  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  30.73 
 
 
351 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.15 
 
 
591 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.87 
 
 
545 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  31.53 
 
 
451 aa  95.9  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 
544 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 
567 aa  94.7  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  30.28 
 
 
351 aa  94.7  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  30.28 
 
 
351 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 
456 aa  94.7  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  30.28 
 
 
351 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  30.28 
 
 
351 aa  94.7  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
513 aa  94.4  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  30.28 
 
 
351 aa  94.7  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  31.53 
 
 
456 aa  94.4  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  30.28 
 
 
351 aa  94.4  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
451 aa  94  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  29.82 
 
 
351 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  27.9 
 
 
1739 aa  93.6  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3064  putative signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
801 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.998121  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  33.33 
 
 
447 aa  93.6  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
412 aa  92.8  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  27.99 
 
 
380 aa  93.6  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  29.82 
 
 
351 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  32.8 
 
 
462 aa  92.8  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  32.14 
 
 
497 aa  92.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  30.59 
 
 
407 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  33.77 
 
 
412 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
552 aa  92  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  29.82 
 
 
388 aa  92  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 
545 aa  91.3  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  30.2 
 
 
422 aa  91.3  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
475 aa  90.9  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
469 aa  90.5  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
394 aa  90.5  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  34.25 
 
 
460 aa  90.5  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
352 aa  90.5  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
480 aa  90.1  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 
391 aa  90.1  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
480 aa  90.1  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
401 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  31.84 
 
 
470 aa  89.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
471 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 
548 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 
571 aa  89.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  29.28 
 
 
387 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7345  histidine kinase  32.86 
 
 
448 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0358279 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
442 aa  88.6  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
459 aa  88.6  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
490 aa  88.6  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
461 aa  88.2  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  30.41 
 
 
430 aa  88.2  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1874  histidine kinase  31.53 
 
 
293 aa  87.8  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>