More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1285 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
742 aa  1480    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2927  histidine kinase  32.28 
 
 
717 aa  288  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340579  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  40.55 
 
 
1033 aa  163  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2604  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
1254 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.545668  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  38.63 
 
 
1048 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 
652 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 
508 aa  147  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
468 aa  145  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  37.7 
 
 
422 aa  145  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  38.68 
 
 
1031 aa  144  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  36.79 
 
 
431 aa  138  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  38.03 
 
 
2361 aa  137  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1747  histidine kinase  28.73 
 
 
1452 aa  136  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
517 aa  131  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  37.62 
 
 
430 aa  130  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  36.02 
 
 
392 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1308  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 
381 aa  127  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000110665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 
391 aa  125  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 
725 aa  124  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  35.96 
 
 
387 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  33.73 
 
 
462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4745  Histidine kinase  38.68 
 
 
362 aa  122  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  36.28 
 
 
518 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  31.19 
 
 
391 aa  121  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2790  Sensor DegS domain protein  36.1 
 
 
393 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  37.94 
 
 
640 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  28.13 
 
 
402 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
412 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
771 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
490 aa  119  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0890149 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  38.14 
 
 
395 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0174  histidine kinase  32.72 
 
 
432 aa  118  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 
574 aa  117  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
748 aa  117  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 
662 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  32.73 
 
 
412 aa  117  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2170  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 
438 aa  117  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.289043  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
370 aa  117  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  36.78 
 
 
662 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
412 aa  116  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  34.62 
 
 
379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
658 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  33.48 
 
 
407 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
581 aa  115  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
770 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
352 aa  115  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
682 aa  115  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0833  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  35.71 
 
 
646 aa  114  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0228489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  32.95 
 
 
772 aa  114  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  36.71 
 
 
357 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
372 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  32.27 
 
 
413 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
344 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  30.5 
 
 
388 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
412 aa  112  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
700 aa  112  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  35.22 
 
 
397 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0321  sensor histidine kinase, putative  30.96 
 
 
339 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
357 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  35.75 
 
 
357 aa  111  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
440 aa  111  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
779 aa  111  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0718  histidine kinase  35.45 
 
 
433 aa  111  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 
401 aa  110  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  30.67 
 
 
395 aa  110  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3162  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
381 aa  110  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.541775  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
445 aa  110  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  35.41 
 
 
501 aa  110  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2483  histidine kinase  38.16 
 
 
401 aa  110  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0411509  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  37.81 
 
 
493 aa  109  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
775 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 
1030 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223882  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  30.74 
 
 
482 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  35.94 
 
 
373 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 
363 aa  108  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
407 aa  108  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
573 aa  107  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
775 aa  107  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
469 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
475 aa  106  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0073  Histidine kinase  33.81 
 
 
409 aa  106  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
370 aa  105  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
346 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
359 aa  105  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3749  putative signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
1018 aa  105  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0973084  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
332 aa  105  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  31.14 
 
 
422 aa  105  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
410 aa  104  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
610 aa  104  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 
425 aa  104  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
564 aa  104  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  32.75 
 
 
380 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
411 aa  103  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0902  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
509 aa  103  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4605  histidine kinase  30.89 
 
 
403 aa  103  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1142  Signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
402 aa  102  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  31.58 
 
 
1226 aa  103  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  29.87 
 
 
223 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
403 aa  103  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3495  signal transduction histidine kinase-like protein  34.77 
 
 
410 aa  102  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0736574  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>