More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1413 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
568 aa  1126    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.69 
 
 
559 aa  369  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 
566 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 
566 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 
566 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 
595 aa  355  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 
566 aa  338  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 
568 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
568 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
568 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  40.73 
 
 
573 aa  335  1e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  37.7 
 
 
578 aa  333  6e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  39.43 
 
 
572 aa  332  9e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
575 aa  332  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 
568 aa  327  5e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
571 aa  312  7.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 
567 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  39.68 
 
 
591 aa  306  9.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  40.43 
 
 
573 aa  300  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
578 aa  299  9e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 
573 aa  295  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.29 
 
 
566 aa  295  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 
588 aa  289  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
565 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  37.68 
 
 
577 aa  278  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 
592 aa  276  5e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 
580 aa  266  8e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  35.93 
 
 
543 aa  263  4.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  45.71 
 
 
851 aa  262  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  48.63 
 
 
828 aa  259  8e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  34.05 
 
 
549 aa  258  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
543 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.52 
 
 
544 aa  253  8.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
579 aa  248  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
556 aa  247  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  35.75 
 
 
536 aa  243  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
590 aa  229  8e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
535 aa  217  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
571 aa  211  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.28 
 
 
631 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.39 
 
 
525 aa  199  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 
535 aa  184  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23240  histidine kinase with GAF domain protein  30.02 
 
 
635 aa  172  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
550 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  32.41 
 
 
391 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 
409 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  46.41 
 
 
392 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 
381 aa  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
372 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  34.7 
 
 
401 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
456 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  31.2 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
386 aa  114  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 
464 aa  110  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
421 aa  96.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  31.43 
 
 
373 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18330  histidine kinase  31.79 
 
 
382 aa  95.5  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  38 
 
 
484 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  29.79 
 
 
673 aa  92.8  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4655  putative PAS/PAC sensor protein  33.2 
 
 
535 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
345 aa  89  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 
725 aa  86.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 
665 aa  83.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  28.87 
 
 
547 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 
709 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  23.35 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0693  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 
474 aa  79.7  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  24.03 
 
 
523 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.37 
 
 
548 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  32.68 
 
 
485 aa  76.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
417 aa  75.5  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
485 aa  74.7  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4209  putative PAS/PAC sensor protein  28.61 
 
 
795 aa  73.9  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3793  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 
489 aa  73.6  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  30.05 
 
 
527 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5475  histidine kinase  27.78 
 
 
447 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256989  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  22.01 
 
 
652 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4486  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 
582 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0681  sensory box histidine kinase  28.27 
 
 
356 aa  72  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393599  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0415  histidine kinase  26.67 
 
 
600 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 
484 aa  71.6  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
545 aa  70.9  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1937  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  21.71 
 
 
370 aa  70.5  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000507079  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1903  GAF sensor signal transduction histidine kinase  21.71 
 
 
370 aa  70.5  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000111521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0466  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 
780 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00551586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0289  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  32.04 
 
 
474 aa  70.1  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1423  sensor histidine kinase VraS  26.34 
 
 
348 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  27.97 
 
 
662 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
662 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  29.7 
 
 
325 aa  69.7  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1142  Signal transduction histidine kinase  22.82 
 
 
402 aa  69.7  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 
523 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
658 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1935  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  29.52 
 
 
485 aa  68.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.618009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>