More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5475 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5475  histidine kinase  100 
 
 
447 aa  886    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256989  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1935  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  54.4 
 
 
485 aa  425  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.618009  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4943  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.22 
 
 
439 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0766  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 
447 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  32.72 
 
 
1033 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  32.1 
 
 
1031 aa  95.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
412 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4745  Histidine kinase  38.03 
 
 
362 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
725 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  28.09 
 
 
1048 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0486  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
406 aa  87  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 
456 aa  87  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1423  sensor histidine kinase VraS  26.77 
 
 
348 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 
459 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  32.38 
 
 
456 aa  85.5  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  31.67 
 
 
422 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 
459 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0174  histidine kinase  34.43 
 
 
432 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
421 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  33.64 
 
 
591 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0798  histidine kinase  34.4 
 
 
347 aa  84  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  31.78 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
352 aa  82.4  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
571 aa  81.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  30.89 
 
 
430 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  33.46 
 
 
466 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1939  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1973  histidine kinase  25.08 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  32.84 
 
 
470 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
665 aa  80.9  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.57 
 
 
456 aa  80.5  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
661 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  33.09 
 
 
466 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  30.4 
 
 
460 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
480 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
480 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  33.09 
 
 
466 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  33.08 
 
 
430 aa  80.1  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  32.72 
 
 
466 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  29.62 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6439  histidine kinase  27.57 
 
 
657 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
461 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.91 
 
 
652 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  28.96 
 
 
351 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 
451 aa  79.7  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  30.1 
 
 
399 aa  79.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1308  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000110665  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  31.84 
 
 
547 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  28.89 
 
 
351 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  32.72 
 
 
466 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  32.72 
 
 
466 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  32.72 
 
 
466 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0073  Histidine kinase  34.16 
 
 
409 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
459 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
508 aa  79  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  32.65 
 
 
431 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
385 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.17 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6208  histidine kinase  33.98 
 
 
657 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2927  histidine kinase  33.33 
 
 
717 aa  77.4  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340579  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
489 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.748441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  31.79 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
441 aa  77  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 
381 aa  77  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  26.82 
 
 
523 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  29.89 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  29.2 
 
 
462 aa  76.6  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  33.04 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  27.6 
 
 
351 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  33.8 
 
 
410 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
411 aa  76.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  28.57 
 
 
351 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
407 aa  76.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0607  histidine kinase  31.73 
 
 
413 aa  75.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.31 
 
 
1648 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  29.41 
 
 
407 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  27.6 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  27.6 
 
 
351 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  27.6 
 
 
351 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
481 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  27.6 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
658 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
523 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.24 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  27.6 
 
 
351 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
500 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  31.49 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 
421 aa  75.5  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
581 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  27.6 
 
 
351 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  32.56 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  30.27 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5416  sensor histidine kinase  26.91 
 
 
516 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
567 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
370 aa  74.7  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
535 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  30.15 
 
 
501 aa  74.3  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>