More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4943 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4943  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 439 aa  855    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5475  histidine kinase  44.22 
 
 		 447 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256989  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0766  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 447 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1935  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  41.35 
 
 		 485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.618009  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  33.86 
 
 		 1031 aa  94.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 407 aa  94  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  42.31 
 
 		 388 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  36.02 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  35.2 
 
 		 430 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1423  sensor histidine kinase VraS  26.67 
 
 		 348 aa  90.9  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  32.69 
 
 		 373 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1973  histidine kinase  25.65 
 
 		 347 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1939  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 		 347 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  28.38 
 
 		 1033 aa  87  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 500 aa  86.3  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  30.7 
 
 		 351 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  33.33 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  34.91 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0073  Histidine kinase  32.53 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  30.23 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  30.23 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  30.23 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  30.23 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  30.23 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  30.23 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  30.23 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 748 aa  83.2  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  29.95 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 394 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 595 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 658 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  34.18 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 596 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.76 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  23.88 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0718  histidine kinase  34.51 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 665 aa  80.9  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.55 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  32.03 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  32.28 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  33.2 
 
 		 462 aa  79.7  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  29.3 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2927  histidine kinase  34.06 
 
 		 717 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5787  histidine kinase  34.96 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  32.32 
 
 		 662 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 662 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6439  histidine kinase  27.94 
 
 		 657 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 725 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0321  sensor histidine kinase, putative  27.56 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 546 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  37.27 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  27.12 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2244  sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  25.78 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  33.74 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  29.17 
 
 		 591 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  25.78 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2045  sensor histidine kinase  25.78 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  25.78 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  33.33 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 594 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  34.58 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3079  sensor histidine kinase  27.11 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000507367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  30.45 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.693223  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  25.78 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  33.9 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 770 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  30.97 
 
 		 598 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 508 aa  76.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0486  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  30.07 
 
 		 580 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2292  sensor histidine kinase  26.22 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  32.77 
 
 		 466 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2326  histidine kinase  25.37 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 598 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.09 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 682 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  32.77 
 
 		 466 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  35 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  32.77 
 
 		 466 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  31.98 
 
 		 488 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  28.51 
 
 		 1048 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 1030 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223882  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  29.72 
 
 		 501 aa  75.1  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.13 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2374  sensor histidine kinase  25.78 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0968027  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 468 aa  74.3  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  29.84 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 541 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>