More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2433 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 461 aa  900    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  53.95 
 
 		 402 aa  299  6e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.96 
 
 		 403 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  44.49 
 
 		 429 aa  246  6.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  44.71 
 
 		 442 aa  242  9e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.87 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.2 
 
 		 417 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  42.69 
 
 		 463 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  52.21 
 
 		 416 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  43.38 
 
 		 435 aa  187  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 586 aa  183  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  50.95 
 
 		 452 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.7 
 
 		 466 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.27 
 
 		 405 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  38.05 
 
 		 405 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  38.08 
 
 		 430 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.63 
 
 		 433 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.25 
 
 		 405 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  44.02 
 
 		 420 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.07 
 
 		 386 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  39.19 
 
 		 429 aa  169  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  48.28 
 
 		 412 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 		 435 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 		 435 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 		 435 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.92 
 
 		 415 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 326 aa  166  8e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  41.7 
 
 		 410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  40.59 
 
 		 463 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 408 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  43.33 
 
 		 439 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 		 418 aa  163  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 408 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  43.61 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.19 
 
 		 375 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  43.9 
 
 		 489 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  37.39 
 
 		 433 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  38.65 
 
 		 429 aa  156  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  35.68 
 
 		 438 aa  156  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 428 aa  156  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  35.45 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 		 432 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 624 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  46.88 
 
 		 580 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 438 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  46.58 
 
 		 570 aa  153  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.88 
 
 		 508 aa  153  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 		 382 aa  153  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 445 aa  150  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 444 aa  149  9e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  43.68 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 445 aa  148  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.84 
 
 		 411 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 492 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.07 
 
 		 459 aa  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  35.34 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  43.64 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  38.73 
 
 		 419 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 		 343 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.41 
 
 		 621 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  44.19 
 
 		 587 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  33.95 
 
 		 442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  42.37 
 
 		 374 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  42.86 
 
 		 476 aa  137  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  39.22 
 
 		 426 aa  137  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.19 
 
 		 565 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.26 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  33.57 
 
 		 446 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 388 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  48.18 
 
 		 454 aa  131  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  38.02 
 
 		 410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  41.36 
 
 		 237 aa  130  7.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.19 
 
 		 725 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.39 
 
 		 422 aa  128  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.37 
 
 		 594 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 		 618 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.227088  decreased coverage  0.00155525 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 		 465 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  35.71 
 
 		 365 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5166  putative signal transduction histidine kinase  42.38 
 
 		 537 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 576 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1533  histidine kinase  41.78 
 
 		 451 aa  103  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0245  hypothetical protein  38.43 
 
 		 578 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 521 aa  101  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  35.71 
 
 		 453 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 401 aa  96.7  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 401 aa  96.7  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  30.9 
 
 		 527 aa  96.3  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  29.77 
 
 		 287 aa  95.5  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 535 aa  95.5  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 401 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  34.67 
 
 		 396 aa  94.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 475 aa  94  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0248  putative signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 470 aa  93.2  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06640  histidine kinase  31.47 
 
 		 404 aa  90.5  6e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.106239  normal  0.143286 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 447 aa  90.1  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4245  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 595 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>