More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3288 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  100 
 
 		 375 aa  734    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  52.96 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  48.31 
 
 		 380 aa  253  5.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  42.4 
 
 		 380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  39.68 
 
 		 442 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  37.39 
 
 		 378 aa  179  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.05 
 
 		 370 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.63 
 
 		 394 aa  169  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  44.59 
 
 		 442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  37.7 
 
 		 372 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 405 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  35.44 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 403 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  44.86 
 
 		 367 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  37.4 
 
 		 395 aa  159  9e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  34.71 
 
 		 392 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  41.3 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 496 aa  149  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  36.68 
 
 		 393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  41.95 
 
 		 443 aa  146  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  39.57 
 
 		 400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  31.19 
 
 		 478 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  41.98 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  34.2 
 
 		 399 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.11 
 
 		 380 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  39.29 
 
 		 430 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.77 
 
 		 415 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  31.48 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  41.2 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  37.37 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  36 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4118  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  34.74 
 
 		 376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  31.71 
 
 		 433 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  31.6 
 
 		 438 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.6 
 
 		 406 aa  139  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  43.48 
 
 		 428 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  34.91 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  38.96 
 
 		 447 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4685  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 467 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  34.83 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.64 
 
 		 378 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 441 aa  136  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  38.8 
 
 		 393 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  39.06 
 
 		 414 aa  136  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1732  histidine kinase  33.43 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  38.4 
 
 		 462 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  34.75 
 
 		 402 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  40.42 
 
 		 399 aa  133  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 407 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 439 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 420 aa  132  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  40.58 
 
 		 369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  39.04 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  39.27 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  37 
 
 		 422 aa  130  5.0000000000000004e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  37.89 
 
 		 410 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.33 
 
 		 424 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2467  histidine kinase  44.29 
 
 		 409 aa  129  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.3 
 
 		 392 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  33.85 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  35.07 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 398 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  29.26 
 
 		 430 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 500 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  33.62 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  38.5 
 
 		 379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 391 aa  126  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  38.6 
 
 		 372 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.91 
 
 		 386 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1617  histidine kinase  35.15 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 441 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  35.95 
 
 		 384 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.23 
 
 		 430 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4945  histidine kinase  36.39 
 
 		 351 aa  123  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 394 aa  124  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  35.59 
 
 		 407 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  31.48 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  38.57 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.01 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.109837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1301  histidine kinase  39.23 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.370703  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 445 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 612 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  29.64 
 
 		 401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  37.83 
 
 		 395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 444 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4578  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.28 
 
 		 370 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000329191  unclonable  0.0000000414728 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.44 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 423 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  35.47 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2556  histidine kinase  41.67 
 
 		 416 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121674  normal  0.0692801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  37 
 
 		 379 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  31.87 
 
 		 420 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>