More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1019 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  100 
 
 
392 aa  762    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  42.62 
 
 
405 aa  217  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  41.4 
 
 
399 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  43.47 
 
 
410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  40.79 
 
 
388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  47.16 
 
 
428 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.23 
 
 
378 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  55.45 
 
 
383 aa  192  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  37.6 
 
 
423 aa  189  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.08 
 
 
400 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  44.26 
 
 
400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2680  Signal transduction histidine kinase-like protein  51.44 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.913052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  44.56 
 
 
399 aa  184  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 
420 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  40.4 
 
 
408 aa  183  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.19 
 
 
392 aa  182  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  46.77 
 
 
447 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 
439 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  37.93 
 
 
433 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
420 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  41.76 
 
 
478 aa  177  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.55 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 
441 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  47.74 
 
 
367 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  45.49 
 
 
384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  36.9 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  43.87 
 
 
417 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  46.74 
 
 
443 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  41.6 
 
 
397 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  36.68 
 
 
430 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  46.18 
 
 
402 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.03 
 
 
406 aa  169  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  39.17 
 
 
442 aa  169  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7811  histidine kinase  43.73 
 
 
291 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 
441 aa  169  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  40.86 
 
 
399 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 
394 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 
445 aa  168  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  46.64 
 
 
408 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  42.13 
 
 
395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  39.59 
 
 
422 aa  164  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  43.37 
 
 
406 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  36.49 
 
 
430 aa  163  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.95 
 
 
407 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  36.29 
 
 
438 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  45.63 
 
 
612 aa  159  6e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 
394 aa  159  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
424 aa  159  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  47.14 
 
 
372 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
403 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
398 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  42.74 
 
 
462 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  38.02 
 
 
381 aa  156  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  41.67 
 
 
372 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  36.26 
 
 
408 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  45.95 
 
 
372 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  46.61 
 
 
470 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.35 
 
 
415 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  33.8 
 
 
402 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  36.49 
 
 
384 aa  153  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.44 
 
 
386 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.41 
 
 
360 aa  152  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.109837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4578  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.99 
 
 
370 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.18 
 
 
430 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.91 
 
 
379 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  41.24 
 
 
395 aa  150  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.72 
 
 
401 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2450  histidine kinase  43.63 
 
 
432 aa  150  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.516192  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.93 
 
 
424 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  45.77 
 
 
384 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  36.25 
 
 
380 aa  149  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  44.33 
 
 
457 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  35.8 
 
 
380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  39.21 
 
 
439 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  43.78 
 
 
394 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 
401 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  47.26 
 
 
357 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
500 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.47 
 
 
357 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  39.61 
 
 
393 aa  143  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  41.32 
 
 
419 aa  143  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  43.15 
 
 
402 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.91 
 
 
382 aa  142  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  41.57 
 
 
449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  41.03 
 
 
443 aa  141  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  35.73 
 
 
393 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  35.4 
 
 
379 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  40.91 
 
 
414 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
382 aa  139  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1884  histidine kinase  41.6 
 
 
383 aa  139  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0784201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2459  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.18 
 
 
384 aa  139  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134403  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  38.78 
 
 
407 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
421 aa  138  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 
387 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
444 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 
423 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  42.19 
 
 
414 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04490  signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>