More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2532 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 
400 aa  795    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  43.16 
 
 
388 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  37.32 
 
 
433 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  35.57 
 
 
400 aa  179  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  40.26 
 
 
399 aa  177  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  48.78 
 
 
392 aa  176  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  36.76 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  36.87 
 
 
405 aa  169  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  40.96 
 
 
378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 
394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  36.73 
 
 
417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  40.26 
 
 
410 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  41.45 
 
 
392 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  37.59 
 
 
478 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 
441 aa  160  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.91 
 
 
406 aa  160  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  46.19 
 
 
367 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  41.67 
 
 
430 aa  159  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  41.34 
 
 
384 aa  158  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
420 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  43.08 
 
 
383 aa  156  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  39.44 
 
 
422 aa  155  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  45.38 
 
 
428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  40.65 
 
 
423 aa  152  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 
441 aa  149  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.6 
 
 
403 aa  149  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  41.98 
 
 
470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  36.62 
 
 
395 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 
445 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  40.55 
 
 
430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  36.63 
 
 
408 aa  146  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  40.7 
 
 
443 aa  146  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
405 aa  146  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  48.58 
 
 
402 aa  146  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  35.44 
 
 
395 aa  145  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
444 aa  145  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  41.57 
 
 
447 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  41.53 
 
 
442 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.7 
 
 
379 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
406 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  42.29 
 
 
443 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 
394 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  44.33 
 
 
462 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4578  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.45 
 
 
370 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  40.56 
 
 
380 aa  143  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2680  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.18 
 
 
271 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.913052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  32.51 
 
 
393 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  41.63 
 
 
372 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 
424 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
421 aa  141  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  43.41 
 
 
416 aa  140  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  40.76 
 
 
401 aa  139  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  40.81 
 
 
399 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 
445 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  41.74 
 
 
408 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  39.08 
 
 
407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.05 
 
 
415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  34.41 
 
 
408 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
439 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.39 
 
 
424 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  39.06 
 
 
372 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.04 
 
 
407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7811  histidine kinase  38.96 
 
 
291 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  39.71 
 
 
393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.4 
 
 
386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  39.5 
 
 
414 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  40.16 
 
 
393 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  38.66 
 
 
402 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
496 aa  133  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  42.67 
 
 
419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  39.63 
 
 
380 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  39.23 
 
 
439 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  35.45 
 
 
445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
420 aa  130  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  36.1 
 
 
438 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.55 
 
 
430 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  44.28 
 
 
357 aa  129  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  37.08 
 
 
397 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2086  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.54 
 
 
389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724108  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  32.16 
 
 
378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 
360 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.109837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  38.32 
 
 
381 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4261  histidine kinase  39.37 
 
 
429 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.39 
 
 
500 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  41.78 
 
 
380 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  32.28 
 
 
442 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
441 aa  126  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  40.76 
 
 
380 aa  126  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  42.31 
 
 
369 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
398 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0607  histidine kinase  41.63 
 
 
434 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  41.23 
 
 
382 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03530  signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 
484 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  41.86 
 
 
457 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4685  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
467 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 
437 aa  123  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14079  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 
470 aa  123  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.81 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>