More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0111 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  100 
 
 
372 aa  717    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  48.39 
 
 
381 aa  295  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.2 
 
 
380 aa  242  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  45.14 
 
 
395 aa  219  6e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.43 
 
 
370 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 
403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.87 
 
 
394 aa  213  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 
405 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  51.42 
 
 
380 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  44.11 
 
 
367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  45.82 
 
 
380 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  40.46 
 
 
442 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 
496 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  39.94 
 
 
380 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  39.94 
 
 
405 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 
441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  36.89 
 
 
378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  40.82 
 
 
442 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4945  histidine kinase  53.54 
 
 
351 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228101  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
445 aa  180  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  38.72 
 
 
430 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  39.94 
 
 
399 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  41.96 
 
 
392 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  37.08 
 
 
375 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  50.24 
 
 
462 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  49.02 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  38.08 
 
 
423 aa  173  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
421 aa  171  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
444 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  41.11 
 
 
402 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  38.05 
 
 
414 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  37.58 
 
 
410 aa  169  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  39.44 
 
 
393 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  38.42 
 
 
408 aa  169  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  47.22 
 
 
428 aa  168  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  39.78 
 
 
438 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  42.63 
 
 
430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.21 
 
 
386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  37.35 
 
 
399 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.72 
 
 
378 aa  166  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 
439 aa  166  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  36.78 
 
 
387 aa  165  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.67 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  35.43 
 
 
408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.93 
 
 
430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.2 
 
 
406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4685  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
467 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  34.81 
 
 
400 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.74 
 
 
394 aa  163  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 
388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 
382 aa  162  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52 
 
 
393 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000329191  unclonable  0.0000000414728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 
398 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  40.69 
 
 
402 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  45.22 
 
 
393 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  35.48 
 
 
433 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  38.05 
 
 
384 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  40.59 
 
 
402 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  47.03 
 
 
401 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 
424 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.21 
 
 
423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  36.89 
 
 
422 aa  153  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  46.7 
 
 
449 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.94 
 
 
406 aa  153  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  37.31 
 
 
384 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
420 aa  152  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  38.02 
 
 
443 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4118  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  40.3 
 
 
376 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  38.83 
 
 
408 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 
500 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.07 
 
 
357 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  37.97 
 
 
417 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1732  histidine kinase  35.7 
 
 
387 aa  150  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424058  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 
441 aa  149  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 
612 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  39.83 
 
 
478 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  46.12 
 
 
388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  37.2 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  38.21 
 
 
376 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 
392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  36.7 
 
 
443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  43.84 
 
 
404 aa  145  9e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  33.5 
 
 
446 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2086  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.79 
 
 
389 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724108  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  36.86 
 
 
447 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  43.12 
 
 
399 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 
398 aa  143  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  41.18 
 
 
397 aa  143  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  42.48 
 
 
414 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  39.39 
 
 
422 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.46 
 
 
424 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7416  histidine kinase  38.69 
 
 
378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375707  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 
407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2823  histidine kinase  36.21 
 
 
413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302112  normal  0.674587 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  46.77 
 
 
416 aa  139  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  43.69 
 
 
369 aa  139  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1884  histidine kinase  38.69 
 
 
383 aa  139  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0784201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  42.47 
 
 
379 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  45.5 
 
 
457 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>