More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3027 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  100 
 
 		 449 aa  868    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.03 
 
 		 500 aa  430  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  49.43 
 
 		 443 aa  347  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  44.27 
 
 		 441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  44.26 
 
 		 430 aa  299  8e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  43.26 
 
 		 430 aa  286  5e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  43.75 
 
 		 406 aa  272  9e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  39.46 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  46.09 
 
 		 408 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  35.88 
 
 		 442 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  36.49 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  33.42 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  35.04 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 403 aa  150  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  41.63 
 
 		 399 aa  149  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  39.74 
 
 		 422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  47.6 
 
 		 410 aa  146  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 420 aa  146  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  33.07 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  45.81 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  40.15 
 
 		 423 aa  144  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  36.46 
 
 		 393 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  35 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  33.33 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  44.65 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 445 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  38.29 
 
 		 397 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.89 
 
 		 406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  36.24 
 
 		 428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 405 aa  140  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  34.57 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  43.85 
 
 		 367 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0607  histidine kinase  40.38 
 
 		 434 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 		 424 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  41.95 
 
 		 380 aa  136  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  32.92 
 
 		 478 aa  136  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.34 
 
 		 407 aa  133  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.04 
 
 		 424 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 		 407 aa  133  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  43.9 
 
 		 419 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 		 439 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  34.42 
 
 		 384 aa  133  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  43.32 
 
 		 402 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 		 394 aa  132  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  36.4 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  33.68 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4052  histidine kinase  41.9 
 
 		 385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  40.6 
 
 		 442 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  37.23 
 
 		 393 aa  130  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39190  signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 		 601 aa  130  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.240452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  33.07 
 
 		 439 aa  130  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8801  putative two-component system sensor kinase  40 
 
 		 359 aa  130  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  38.86 
 
 		 462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  37.64 
 
 		 407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 		 612 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  33.85 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 		 496 aa  127  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  35.36 
 
 		 369 aa  126  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.6 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0608  histidine kinase  41.83 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7416  histidine kinase  35.23 
 
 		 378 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  38.3 
 
 		 381 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.51 
 
 		 370 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  42.38 
 
 		 457 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  40.85 
 
 		 422 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  43.23 
 
 		 388 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  36.5 
 
 		 395 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 421 aa  124  5e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  35.05 
 
 		 443 aa  123  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.57 
 
 		 386 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  40.79 
 
 		 383 aa  122  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.68 
 
 		 430 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.79 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  38.66 
 
 		 402 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4469  putative two-component system sensor kinase  34.92 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  40.83 
 
 		 380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  41.75 
 
 		 380 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 		 372 aa  120  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.75 
 
 		 393 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000329191  unclonable  0.0000000414728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  34.86 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3997  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.83 
 
 		 567 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224789  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.41 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  31.78 
 
 		 428 aa  118  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.6 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  33.78 
 
 		 394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  35.74 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.34 
 
 		 415 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2459  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.89 
 
 		 384 aa  116  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  37.93 
 
 		 408 aa  117  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0309  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.69 
 
 		 400 aa  117  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33000  signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 411 aa  117  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  32.39 
 
 		 372 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.09 
 
 		 379 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7811  histidine kinase  39.37 
 
 		 291 aa  116  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>