More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6530 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  100 
 
 		 372 aa  729    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  41.13 
 
 		 417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  40.56 
 
 		 439 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 420 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  40.91 
 
 		 395 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  42.77 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  40.74 
 
 		 410 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  36.99 
 
 		 405 aa  182  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 		 394 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  36.97 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 		 398 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  41.74 
 
 		 384 aa  169  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  42.68 
 
 		 399 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  38.48 
 
 		 402 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  35.33 
 
 		 422 aa  168  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  38.35 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  38 
 
 		 428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  35.36 
 
 		 397 aa  160  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  40.16 
 
 		 407 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 445 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  41.77 
 
 		 421 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  42.58 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.05 
 
 		 424 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.36 
 
 		 415 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  39.41 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 		 424 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  35.71 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  40.98 
 
 		 443 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  41.86 
 
 		 392 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 439 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 379 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  37.46 
 
 		 384 aa  138  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  37.46 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.86 
 
 		 386 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  34.46 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.09 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  31.78 
 
 		 400 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 		 441 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  35.08 
 
 		 381 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 500 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03530  signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 		 484 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 496 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  39.83 
 
 		 442 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  32.23 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4135  putative signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6695  two component LuxR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 398 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04490  signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 469 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2680  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.26 
 
 		 271 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.913052 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3913  histidine kinase  39.73 
 
 		 458 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  32.36 
 
 		 399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 403 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2459  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.32 
 
 		 384 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.29 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2450  histidine kinase  38.1 
 
 		 432 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.516192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.5 
 
 		 357 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  31.71 
 
 		 402 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  35.15 
 
 		 369 aa  126  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4578  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.35 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4052  histidine kinase  37.6 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  35.78 
 
 		 395 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  36.74 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  41.09 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  38.18 
 
 		 380 aa  123  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  40.69 
 
 		 382 aa  123  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  39.52 
 
 		 408 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  31.99 
 
 		 430 aa  123  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.89 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0670  signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 869 aa  122  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  34.95 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  33.51 
 
 		 443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  40.89 
 
 		 357 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7014  histidine kinase  39.38 
 
 		 388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149042  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.98 
 
 		 383 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  33.15 
 
 		 438 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  34.77 
 
 		 380 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  30.71 
 
 		 430 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  29.02 
 
 		 384 aa  120  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  34.22 
 
 		 408 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  33.23 
 
 		 372 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 		 470 aa  119  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4861  histidine kinase  33.91 
 
 		 390 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0904553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  35.18 
 
 		 399 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  33.33 
 
 		 478 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4469  putative two-component system sensor kinase  33.24 
 
 		 384 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.09 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 		 469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 503 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  38.59 
 
 		 393 aa  116  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 386 aa  116  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 423 aa  116  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  32.24 
 
 		 424 aa  116  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2556  histidine kinase  36.3 
 
 		 416 aa  116  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121674  normal  0.0692801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>