More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1050 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  100 
 
 		 421 aa  817    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.99 
 
 		 470 aa  212  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3913  histidine kinase  36.76 
 
 		 458 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4135  putative signal transduction histidine kinase  39.4 
 
 		 444 aa  196  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 		 508 aa  196  9e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0044423 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03530  signal transduction histidine kinase  50.21 
 
 		 484 aa  196  9e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 420 aa  192  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 		 503 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  49.21 
 
 		 417 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 		 420 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  37.82 
 
 		 423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  44.18 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 398 aa  170  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  49.19 
 
 		 447 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 441 aa  170  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  44.31 
 
 		 422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  41.13 
 
 		 397 aa  166  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  39.8 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  37.13 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  39.83 
 
 		 395 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 		 445 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  37.68 
 
 		 399 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  44.22 
 
 		 407 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  45.8 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  33.73 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  41.88 
 
 		 433 aa  159  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  42.8 
 
 		 405 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  33.17 
 
 		 478 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 441 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  37.26 
 
 		 408 aa  156  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  41.77 
 
 		 372 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  41.7 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6695  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 398 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  35.68 
 
 		 384 aa  150  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  33.77 
 
 		 367 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  35.11 
 
 		 394 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.04 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4052  histidine kinase  35.92 
 
 		 385 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  36.72 
 
 		 442 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  32.71 
 
 		 438 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2450  histidine kinase  39.05 
 
 		 432 aa  143  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.516192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  35.05 
 
 		 428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 496 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 424 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 405 aa  136  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.7 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 387 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  44.88 
 
 		 369 aa  133  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  32.74 
 
 		 443 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  38.26 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  37.5 
 
 		 428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  32.12 
 
 		 443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.52 
 
 		 392 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 469 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 445 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  41.99 
 
 		 388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  38 
 
 		 424 aa  130  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  34.31 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.41 
 
 		 370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  34.44 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  33.62 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  43.17 
 
 		 470 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  33.68 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  38.36 
 
 		 442 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  31.66 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  35.85 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.8 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.25 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0292279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  37.25 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1821  histidine kinase  35.98 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  0.0945618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 386 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4578  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.65 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  37.9 
 
 		 392 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.88 
 
 		 430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  32.31 
 
 		 424 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0240  histidine kinase  37.02 
 
 		 370 aa  120  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  34.1 
 
 		 399 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 392 aa  119  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  40.87 
 
 		 408 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19750  signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  35.84 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.69 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  41 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 		 438 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  32.78 
 
 		 446 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  33.46 
 
 		 395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4068  histidine kinase  35.43 
 
 		 383 aa  117  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.419226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 391 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7657  histidine kinase  44.23 
 
 		 434 aa  116  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0277  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>