More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1999 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 503 aa  943    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  38.45 
 
 		 421 aa  236  8e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 		 470 aa  189  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  42.01 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03530  signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 		 484 aa  172  9e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3913  histidine kinase  34.33 
 
 		 458 aa  166  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  41.39 
 
 		 439 aa  159  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4135  putative signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 		 444 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  41.95 
 
 		 402 aa  157  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  39.72 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  45.66 
 
 		 372 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  40.92 
 
 		 447 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 441 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  43.87 
 
 		 410 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  44.57 
 
 		 407 aa  146  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  40 
 
 		 442 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  41.61 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  34.24 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  39.8 
 
 		 367 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  34.41 
 
 		 399 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  34.93 
 
 		 478 aa  137  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  42.22 
 
 		 428 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  36.4 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  32.92 
 
 		 384 aa  133  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  38.06 
 
 		 397 aa  133  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  37.78 
 
 		 422 aa  133  9e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  41.63 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  37.35 
 
 		 443 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  40.5 
 
 		 394 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  37.11 
 
 		 430 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  37.31 
 
 		 405 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6695  two component LuxR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 398 aa  130  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.93 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  40.61 
 
 		 402 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.64 
 
 		 406 aa  126  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 469 aa  126  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  36.57 
 
 		 433 aa  123  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  34.62 
 
 		 384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 524 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00577691  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 416 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 403 aa  116  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  40.25 
 
 		 457 aa  116  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  35.89 
 
 		 381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2450  histidine kinase  39.11 
 
 		 432 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.516192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04490  signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 469 aa  113  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  36.14 
 
 		 399 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  34.39 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  31.81 
 
 		 408 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 441 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.55 
 
 		 379 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  40.52 
 
 		 419 aa  110  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4052  histidine kinase  37 
 
 		 385 aa  110  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  33.43 
 
 		 393 aa  110  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  33 
 
 		 430 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  32.89 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 418 aa  108  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 536 aa  108  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2657  histidine kinase  35.16 
 
 		 426 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  32.69 
 
 		 428 aa  108  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  36.17 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  37.61 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 612 aa  107  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 417 aa  107  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.66 
 
 		 370 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 392 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  36.4 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  36.64 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1821  histidine kinase  36.22 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  0.0945618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  33.52 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.8 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7811  histidine kinase  36.2 
 
 		 291 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 406 aa  104  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  32.41 
 
 		 372 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  38.55 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  39.39 
 
 		 372 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3474  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  33.73 
 
 		 385 aa  103  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0670  signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 869 aa  103  7e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.75 
 
 		 371 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0309  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.21 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  34.32 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.58 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 386 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 401 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  35.37 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7014  histidine kinase  34.51 
 
 		 388 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149042  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02990  signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  32.72 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.17 
 
 		 384 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>