More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3323 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  100 
 
 		 371 aa  731    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  56.47 
 
 		 375 aa  329  6e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  45.4 
 
 		 445 aa  239  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.68 
 
 		 373 aa  239  8e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15920  signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.89616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.23 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.89 
 
 		 469 aa  160  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  39.06 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  41.28 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.21 
 
 		 379 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  34.95 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  36.72 
 
 		 369 aa  133  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  35.16 
 
 		 393 aa  132  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  29.89 
 
 		 400 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  34.78 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  37.9 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  33.33 
 
 		 439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 403 aa  126  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  37.37 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  35.03 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  32.65 
 
 		 424 aa  124  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2232  putative two-component sensor kinase  44.04 
 
 		 375 aa  123  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 418 aa  123  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  30.57 
 
 		 401 aa  122  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  36 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  33.57 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  36.39 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  35.43 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0277  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.74 
 
 		 430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  31.87 
 
 		 443 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  35.26 
 
 		 417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.11 
 
 		 371 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0177  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.81 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 406 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  43.48 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1124  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.09 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 536 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 417 aa  116  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  35.86 
 
 		 395 aa  116  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  33.07 
 
 		 438 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  33.61 
 
 		 399 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2467  histidine kinase  40.41 
 
 		 409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  31.3 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25050  signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193402  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8798  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.24 
 
 		 419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7657  histidine kinase  41.21 
 
 		 434 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  35.51 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  37.66 
 
 		 478 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  35.71 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0309  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 400 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  29.88 
 
 		 422 aa  112  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0760  histidine kinase  32.21 
 
 		 461 aa  112  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.29 
 
 		 384 aa  112  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1618  histidine kinase  37.92 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.790794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0367  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0318683  normal  0.223079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  39.81 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  31.2 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.82 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3997  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.87 
 
 		 567 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224789  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06240  histidine kinase  39.82 
 
 		 438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2690  histidine kinase  30.1 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.172281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  37.68 
 
 		 372 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  30.62 
 
 		 367 aa  110  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4996  histidine kinase  36.78 
 
 		 405 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  29.72 
 
 		 394 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  35.42 
 
 		 423 aa  109  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  33.91 
 
 		 408 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3845  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 392 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.79155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  35.11 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  34.5 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 433 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  36.2 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 612 aa  107  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 420 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  32.72 
 
 		 405 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  35.27 
 
 		 457 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  32.44 
 
 		 374 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 382 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  33.99 
 
 		 372 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7014  histidine kinase  35.35 
 
 		 388 aa  106  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149042  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  31.97 
 
 		 430 aa  106  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  28.95 
 
 		 442 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 426 aa  105  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0276057  hitchhiker  0.000366543 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26890  signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.304615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8899  histidine kinase  30.18 
 
 		 455 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1884  histidine kinase  32.41 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0784201 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  35.22 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  39.15 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>