More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3997 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3997  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 		 567 aa  1103    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224789  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2252  histidine kinase  51.58 
 
 		 386 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 		 424 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  37.33 
 
 		 402 aa  137  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  39.26 
 
 		 422 aa  130  5.0000000000000004e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 394 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  42.97 
 
 		 397 aa  128  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  33.24 
 
 		 399 aa  127  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  32.26 
 
 		 375 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 441 aa  125  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 420 aa  124  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.8 
 
 		 371 aa  123  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 536 aa  123  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 		 386 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  40 
 
 		 394 aa  120  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  37.04 
 
 		 414 aa  120  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  33.46 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  38.98 
 
 		 369 aa  118  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  36.54 
 
 		 417 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  35.83 
 
 		 442 aa  117  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.68 
 
 		 415 aa  117  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 387 aa  116  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.44 
 
 		 379 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  42.21 
 
 		 395 aa  116  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  40 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 376 aa  113  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.479931  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 403 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  36.51 
 
 		 410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 404 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  36.84 
 
 		 430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  40.38 
 
 		 408 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  36.65 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  36.68 
 
 		 428 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.21 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  35.55 
 
 		 395 aa  110  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21860  signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 397 aa  110  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.194284  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.94 
 
 		 386 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  39.2 
 
 		 399 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  40.95 
 
 		 449 aa  110  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  39.24 
 
 		 443 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  33.25 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.11 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.81 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  35.04 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  36.32 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  36.9 
 
 		 420 aa  108  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  39 
 
 		 439 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 441 aa  108  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 470 aa  108  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8801  putative two-component system sensor kinase  37.09 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.18 
 
 		 424 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4052  histidine kinase  38.86 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  40.95 
 
 		 388 aa  107  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.77 
 
 		 430 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  31.02 
 
 		 392 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  35.62 
 
 		 378 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4000  histidine kinase  40.19 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20684  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  32.33 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  35.88 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  37.9 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  35.91 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  37.28 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  36.33 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  35.15 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  33.14 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 		 406 aa  105  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 		 373 aa  105  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  38.93 
 
 		 423 aa  104  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3356  histidine kinase  37.92 
 
 		 426 aa  104  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10189  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  40 
 
 		 393 aa  104  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0623  histidine kinase  35.16 
 
 		 403 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39190  signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 601 aa  103  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.240452 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  39.27 
 
 		 428 aa  103  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  34.47 
 
 		 401 aa  103  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 423 aa  103  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1124  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 422 aa  103  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  38.04 
 
 		 393 aa  103  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 612 aa  103  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5551  histidine kinase  40.38 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  0.129441 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 500 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03530  signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1603  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  34.2 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  34.35 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  34.39 
 
 		 408 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  37.35 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3677  histidine kinase  35.44 
 
 		 408 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  38.39 
 
 		 384 aa  102  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  37.65 
 
 		 555 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  33.78 
 
 		 422 aa  101  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  37.68 
 
 		 457 aa  101  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4578  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.86 
 
 		 370 aa  101  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  33.2 
 
 		 438 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  38.21 
 
 		 372 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0309  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 400 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 442 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  35.15 
 
 		 388 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>