More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2232 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  100 
 
 
399 aa  770    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  50.79 
 
 
379 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  45.62 
 
 
414 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1402  putative two-component system sensor kinase  45.11 
 
 
407 aa  238  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2226  histidine kinase  41.67 
 
 
370 aa  209  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16990  signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 
418 aa  169  8e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.566842 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0337  histidine kinase  39.02 
 
 
408 aa  166  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  36.57 
 
 
423 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0184  regulatory protein LuxR  37.43 
 
 
489 aa  152  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 
403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  41.5 
 
 
416 aa  138  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 
382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
424 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  39.04 
 
 
438 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  37.68 
 
 
395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  39.02 
 
 
428 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  34.94 
 
 
392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  34.77 
 
 
402 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.24 
 
 
370 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  40.52 
 
 
405 aa  133  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  41.98 
 
 
402 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  32.7 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  40.77 
 
 
443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  32.01 
 
 
433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  40 
 
 
393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  34.56 
 
 
478 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.95 
 
 
407 aa  130  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  40.76 
 
 
442 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.06 
 
 
430 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  37.72 
 
 
430 aa  129  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  40.36 
 
 
402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  35.43 
 
 
399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  42.92 
 
 
399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  32.13 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  43.69 
 
 
372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 
445 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
441 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  37.85 
 
 
417 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  33.15 
 
 
442 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 
441 aa  126  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  35.71 
 
 
408 aa  126  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  38.46 
 
 
395 aa  126  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  34.2 
 
 
424 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  39.83 
 
 
430 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
394 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.22 
 
 
406 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.52 
 
 
379 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2657  histidine kinase  39.91 
 
 
426 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  33.25 
 
 
376 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  34.35 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3221  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000231241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  35.33 
 
 
388 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  37.28 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0277  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110389 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.58 
 
 
378 aa  120  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.35 
 
 
383 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  39.41 
 
 
380 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 
406 aa  119  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
469 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1884  histidine kinase  37.05 
 
 
383 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0784201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  37.68 
 
 
462 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  37.21 
 
 
393 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.72 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  34.93 
 
 
372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  38.96 
 
 
414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  32.96 
 
 
378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 
398 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
417 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1124  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 
422 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  38.1 
 
 
445 aa  116  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2467  histidine kinase  42.2 
 
 
409 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241937  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  41.54 
 
 
410 aa  116  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.23 
 
 
371 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 
418 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
439 aa  116  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  32 
 
 
404 aa  116  7.999999999999999e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05840  signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
405 aa  116  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.43766  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 
500 aa  116  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  38 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25050  signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193402  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1875  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0572952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  41.31 
 
 
408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.96 
 
 
384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4218  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.29 
 
 
398 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0481493  hitchhiker  0.000385051 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  41.04 
 
 
401 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  34.53 
 
 
357 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  34.54 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  39.74 
 
 
393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.5 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5402  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.97 
 
 
408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  39.59 
 
 
408 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  36.29 
 
 
395 aa  111  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  40.51 
 
 
384 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.264788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>