More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2232 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2232  putative two-component sensor kinase  100 
 
 		 375 aa  726    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8798  Signal transduction histidine kinase-like protein  59.71 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.85 
 
 		 386 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.9 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1602  histidine kinase  46.67 
 
 		 425 aa  282  8.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  43.86 
 
 		 446 aa  250  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1124  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 422 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2690  histidine kinase  41.88 
 
 		 445 aa  229  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.172281 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  44.01 
 
 		 384 aa  229  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  40.4 
 
 		 393 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5069  histidine kinase  41.83 
 
 		 403 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.29 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 		 469 aa  199  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  38.73 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  39.37 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26890  signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 430 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.304615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4218  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.62 
 
 		 398 aa  189  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0481493  hitchhiker  0.000385051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  36.05 
 
 		 389 aa  183  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 		 417 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  36.62 
 
 		 424 aa  176  5e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4673  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.66 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113165  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 418 aa  168  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0760  histidine kinase  38.63 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25050  signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193402  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 449 aa  159  9e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7657  histidine kinase  48.04 
 
 		 434 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 		 424 aa  153  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.53 
 
 		 415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0295  histidine kinase  43.67 
 
 		 389 aa  142  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.856795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  36.45 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  36.34 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0177  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  36.8 
 
 		 386 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06240  histidine kinase  42.93 
 
 		 438 aa  140  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.36 
 
 		 379 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 		 536 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  40.85 
 
 		 374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  42.74 
 
 		 395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  35.17 
 
 		 375 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  35.57 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  35.62 
 
 		 388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  33.72 
 
 		 442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  43.81 
 
 		 555 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 420 aa  125  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  31.71 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  40.42 
 
 		 420 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  33.92 
 
 		 399 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1884  histidine kinase  35.56 
 
 		 383 aa  123  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0784201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  33.89 
 
 		 402 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  37.22 
 
 		 422 aa  122  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0309  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  31.4 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  32.95 
 
 		 399 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  39.92 
 
 		 423 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 441 aa  119  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2490  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 383 aa  119  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  33.51 
 
 		 372 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.53 
 
 		 371 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0367  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0318683  normal  0.223079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  32.26 
 
 		 422 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  32.26 
 
 		 393 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21610  signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.78 
 
 		 370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  34.77 
 
 		 380 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21860  signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.194284  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0623  histidine kinase  38.36 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25610  histidine kinase  34.2 
 
 		 458 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.309786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 394 aa  113  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  38.91 
 
 		 428 aa  112  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  33.86 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  31.34 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  33.22 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7014  histidine kinase  32.47 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149042  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  34.98 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  33.63 
 
 		 384 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02410  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 428 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8899  histidine kinase  34.68 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.26 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.67 
 
 		 430 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 403 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0670  signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 869 aa  110  5e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.8 
 
 		 424 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0277  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 426 aa  109  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3845  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 392 aa  109  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.79155 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3997  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.72 
 
 		 567 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224789  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2252  histidine kinase  38.61 
 
 		 386 aa  109  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  31.59 
 
 		 430 aa  109  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  33.52 
 
 		 445 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  29.67 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  36.82 
 
 		 430 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 441 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  29.87 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  36.51 
 
 		 478 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>