More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5894 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  100 
 
 		 555 aa  1070    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 536 aa  208  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5263  histidine kinase  39.03 
 
 		 518 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 424 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  42.8 
 
 		 393 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 417 aa  153  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.53 
 
 		 424 aa  150  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  37.62 
 
 		 446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 418 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1909  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.95 
 
 		 391 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114776  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  35.92 
 
 		 408 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  41.29 
 
 		 420 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.51 
 
 		 386 aa  141  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.8 
 
 		 415 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  31.1 
 
 		 430 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.33 
 
 		 379 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  33.83 
 
 		 424 aa  138  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  35.96 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3697  histidine kinase  48.02 
 
 		 313 aa  136  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1602  histidine kinase  40.43 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  42.34 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 469 aa  135  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0760  histidine kinase  37.43 
 
 		 461 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  37.73 
 
 		 428 aa  134  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15920  signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 367 aa  133  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.89616 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  34.76 
 
 		 367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.46 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.53 
 
 		 371 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2446  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.09 
 
 		 601 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.57665  normal  0.0973248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.23 
 
 		 384 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.19 
 
 		 394 aa  130  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  35.55 
 
 		 388 aa  130  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  39.91 
 
 		 374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  39.61 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  37.11 
 
 		 400 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4218  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.28 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0481493  hitchhiker  0.000385051 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1884  histidine kinase  34.47 
 
 		 383 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0784201 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25050  signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 360 aa  125  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193402  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  34.41 
 
 		 389 aa  125  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  33.93 
 
 		 375 aa  124  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 401 aa  123  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  35.99 
 
 		 428 aa  123  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  38.21 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  39.49 
 
 		 395 aa  121  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 441 aa  121  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8798  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.18 
 
 		 419 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 403 aa  120  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.58 
 
 		 435 aa  120  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  34.53 
 
 		 445 aa  120  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  35.06 
 
 		 478 aa  120  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  40.99 
 
 		 395 aa  120  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 564 aa  120  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.452469  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2232  putative two-component sensor kinase  44.9 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  34.26 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  38.1 
 
 		 430 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.69 
 
 		 380 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2690  histidine kinase  34.28 
 
 		 445 aa  117  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.172281 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5069  histidine kinase  35.42 
 
 		 403 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  38.02 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  38.43 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  33.72 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  38.81 
 
 		 393 aa  115  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.93 
 
 		 406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  39.34 
 
 		 457 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  41.71 
 
 		 380 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0367  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 413 aa  114  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0318683  normal  0.223079 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  37.08 
 
 		 443 aa  114  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.49 
 
 		 378 aa  114  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  36.24 
 
 		 399 aa  113  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21610  signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  38.73 
 
 		 381 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25610  histidine kinase  34.46 
 
 		 458 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.309786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1124  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  31.66 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 373 aa  112  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4261  histidine kinase  37.66 
 
 		 429 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0295  histidine kinase  40.17 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.856795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  37.84 
 
 		 367 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2490  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 383 aa  110  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 500 aa  110  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4673  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.14 
 
 		 399 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113165  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0277  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 426 aa  110  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110389 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  33.59 
 
 		 423 aa  110  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  36.79 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 394 aa  109  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  36.63 
 
 		 375 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  33.63 
 
 		 379 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  37.89 
 
 		 419 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 438 aa  109  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26890  signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.304615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7657  histidine kinase  40.38 
 
 		 434 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5402  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.26 
 
 		 408 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  36.61 
 
 		 388 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>