More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2252 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2252  histidine kinase  100 
 
 		 386 aa  746    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3997  Signal transduction histidine kinase-like protein  51.58 
 
 		 567 aa  292  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224789  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 424 aa  142  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3356  histidine kinase  45.87 
 
 		 426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10189  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 		 441 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  33.77 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39190  signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 601 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.240452 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 416 aa  126  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7014  histidine kinase  40.71 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149042  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  37.5 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.479931  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  34.32 
 
 		 399 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.74 
 
 		 379 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.72 
 
 		 415 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  33.81 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  35.86 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.14 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8801  putative two-component system sensor kinase  40.59 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 394 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.4 
 
 		 424 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  39.81 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  34.5 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 		 386 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 441 aa  119  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  32.71 
 
 		 430 aa  119  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1124  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.99 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  35.38 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  33.7 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  29.47 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3677  histidine kinase  36.89 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  37.9 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 420 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.23 
 
 		 401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  33.7 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.33 
 
 		 430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.39 
 
 		 371 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 401 aa  116  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 		 403 aa  116  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  37.08 
 
 		 422 aa  116  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 469 aa  116  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  37.6 
 
 		 402 aa  116  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  34.17 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  38.39 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  37.83 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8798  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.15 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  39.6 
 
 		 408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  36.89 
 
 		 388 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02990  signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 470 aa  113  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  35.07 
 
 		 446 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  37.6 
 
 		 445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  39.58 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03530  signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 		 484 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0670  signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 869 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.39 
 
 		 406 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  36.78 
 
 		 420 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.9 
 
 		 386 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  37.84 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1602  histidine kinase  32.17 
 
 		 425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  31.08 
 
 		 422 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  33.52 
 
 		 380 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  36.09 
 
 		 397 aa  109  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 417 aa  110  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  34.75 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  38.66 
 
 		 442 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  30.17 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4000  histidine kinase  36.49 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20684  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4052  histidine kinase  36.84 
 
 		 385 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.9 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  37.39 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 536 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2232  putative two-component sensor kinase  39 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  36.49 
 
 		 430 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  36.71 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  38.91 
 
 		 394 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  36.97 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21860  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.194284  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  39.24 
 
 		 443 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1617  histidine kinase  36.02 
 
 		 391 aa  107  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  37.28 
 
 		 384 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 		 387 aa  106  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  31.69 
 
 		 438 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  32.88 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.49 
 
 		 400 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  33.16 
 
 		 421 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  43.06 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  32.56 
 
 		 399 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0309  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  36.32 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  33.19 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  40.17 
 
 		 372 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  33.59 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  32.83 
 
 		 428 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>