More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4000 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4000  histidine kinase  100 
 
 		 381 aa  713    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0608  histidine kinase  43.75 
 
 		 351 aa  173  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8801  putative two-component system sensor kinase  42.31 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1301  histidine kinase  42 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.370703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8565  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.14 
 
 		 407 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5551  histidine kinase  37.65 
 
 		 376 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  0.129441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7014  histidine kinase  40.44 
 
 		 388 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149042  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39190  signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 601 aa  136  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.240452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3218  histidine kinase  47.22 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1733  histidine kinase  38 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  41.83 
 
 		 382 aa  123  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 387 aa  122  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  42.45 
 
 		 379 aa  122  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  40.38 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  38.72 
 
 		 408 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  36.51 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  39.71 
 
 		 369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  34.43 
 
 		 384 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  37.23 
 
 		 400 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  34.67 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  39.07 
 
 		 457 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 374 aa  109  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.551521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.24 
 
 		 430 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  40.69 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3005  histidine kinase  38.37 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.165445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.84 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.58 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3997  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.19 
 
 		 567 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224789  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.28 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 		 469 aa  104  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  33.53 
 
 		 424 aa  103  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  39.6 
 
 		 430 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 		 439 aa  103  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 403 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  39.57 
 
 		 420 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.35 
 
 		 401 aa  102  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.67 
 
 		 406 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  37.67 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  36.1 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6305  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.17 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.177267  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.15 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  42.42 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  35.09 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  39.73 
 
 		 442 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  39.13 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03530  signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 484 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  36.65 
 
 		 372 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  40 
 
 		 447 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  39 
 
 		 393 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04490  signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 469 aa  99.8  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  36.09 
 
 		 422 aa  99.8  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  41.79 
 
 		 395 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.9 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 500 aa  99.4  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  32.94 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.44 
 
 		 392 aa  97.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.13 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1620  histidine kinase  39.35 
 
 		 380 aa  98.6  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  37.61 
 
 		 408 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4052  histidine kinase  39.71 
 
 		 385 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 441 aa  97.4  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  40.19 
 
 		 449 aa  97.4  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  35.32 
 
 		 381 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  36.73 
 
 		 395 aa  96.7  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0309  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 400 aa  96.7  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.05 
 
 		 422 aa  96.3  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  30.42 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 612 aa  95.5  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  38.25 
 
 		 379 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  34.98 
 
 		 392 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  33.06 
 
 		 414 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  34.07 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  31.72 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2252  histidine kinase  36.36 
 
 		 386 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2459  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.63 
 
 		 384 aa  94.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  36.17 
 
 		 443 aa  94  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  31.04 
 
 		 367 aa  94  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2467  histidine kinase  39.06 
 
 		 409 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0670  signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 869 aa  94  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  39.11 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  35.44 
 
 		 407 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  36.36 
 
 		 417 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  39.02 
 
 		 384 aa  93.6  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  38.73 
 
 		 371 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.44 
 
 		 378 aa  93.2  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 441 aa  93.2  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 536 aa  93.2  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  36.09 
 
 		 428 aa  93.2  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  35.75 
 
 		 375 aa  92.8  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  33.84 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3845  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 392 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.79155 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1821  histidine kinase  37.24 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  0.0945618 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  39.91 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  37.62 
 
 		 428 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 420 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>