More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0608 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0608  histidine kinase  100 
 
 		 351 aa  658    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8801  putative two-component system sensor kinase  55.98 
 
 		 359 aa  315  8e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4000  histidine kinase  44.78 
 
 		 381 aa  190  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1301  histidine kinase  41.4 
 
 		 389 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.370703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8565  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.98 
 
 		 407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  43.66 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  46.23 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5551  histidine kinase  45 
 
 		 376 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  0.129441 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 		 418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  37.74 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7014  histidine kinase  41.6 
 
 		 388 aa  142  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149042  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39190  signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 601 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.240452 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  37.19 
 
 		 397 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  42.44 
 
 		 402 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1733  histidine kinase  44.3 
 
 		 385 aa  135  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 391 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  41.09 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  42.79 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 394 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.58 
 
 		 370 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  39.73 
 
 		 405 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  44.55 
 
 		 442 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  40.38 
 
 		 401 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3218  histidine kinase  43.58 
 
 		 391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  36.77 
 
 		 399 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 496 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  41.87 
 
 		 379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 420 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  41.83 
 
 		 449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.55 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  37.01 
 
 		 393 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 		 500 aa  126  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  35.03 
 
 		 442 aa  126  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  36.61 
 
 		 399 aa  125  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3845  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 		 392 aa  125  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.79155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  40.31 
 
 		 410 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  38.31 
 
 		 417 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  37.91 
 
 		 422 aa  124  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.04 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0292279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 439 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.07 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  43.78 
 
 		 428 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  37.07 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3913  histidine kinase  39.73 
 
 		 458 aa  123  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03530  signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 484 aa  123  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 		 379 aa  122  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  34.44 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  36.61 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  40.39 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  40.19 
 
 		 443 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  33.69 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  41.26 
 
 		 423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  34.94 
 
 		 438 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  39.32 
 
 		 380 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.74 
 
 		 407 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  33.84 
 
 		 478 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 398 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  36.8 
 
 		 407 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 		 394 aa  119  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2519  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.07 
 
 		 391 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  41.84 
 
 		 395 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  38.5 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  39.61 
 
 		 421 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 406 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  39.63 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  38.18 
 
 		 381 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  39.02 
 
 		 384 aa  116  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  33.97 
 
 		 395 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  38.31 
 
 		 375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  36.49 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  39.64 
 
 		 399 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 470 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  38.76 
 
 		 457 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3005  histidine kinase  40.34 
 
 		 387 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.165445  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 403 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4052  histidine kinase  39.44 
 
 		 385 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.45 
 
 		 415 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  41.31 
 
 		 380 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  40.18 
 
 		 414 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  40.49 
 
 		 367 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  36.73 
 
 		 422 aa  112  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  38.81 
 
 		 430 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  37.63 
 
 		 408 aa  112  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  32.45 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4135  putative signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 444 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.03 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.5 
 
 		 424 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.79 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.85 
 
 		 357 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3997  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.33 
 
 		 567 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224789  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.71 
 
 		 379 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 444 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  36.82 
 
 		 462 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>