More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3005 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3005  histidine kinase  100 
 
 		 387 aa  739    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.165445  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1301  histidine kinase  43.42 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.370703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8565  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.63 
 
 		 407 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5551  histidine kinase  37.79 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  0.129441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4000  histidine kinase  39.15 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20684  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7014  histidine kinase  39.34 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149042  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39190  signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 601 aa  116  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.240452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0608  histidine kinase  41.2 
 
 		 351 aa  115  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8801  putative two-component system sensor kinase  38.24 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1733  histidine kinase  41.74 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 418 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  43.26 
 
 		 379 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  38.1 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  38.38 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  34.71 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 441 aa  95.5  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6305  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.11 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.177267  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 387 aa  93.2  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2459  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.19 
 
 		 384 aa  93.2  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  35.27 
 
 		 381 aa  93.2  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  39.39 
 
 		 399 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2252  histidine kinase  38.83 
 
 		 386 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3218  histidine kinase  38.43 
 
 		 391 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  41.06 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  40.09 
 
 		 402 aa  90.5  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3997  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.17 
 
 		 567 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224789  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 441 aa  90.5  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  35.17 
 
 		 407 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  39.53 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 394 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  36.07 
 
 		 382 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  31.8 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 382 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.11 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  36.79 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 394 aa  86.7  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  34.66 
 
 		 399 aa  86.3  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4861  histidine kinase  32.76 
 
 		 390 aa  86.3  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0904553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  32.43 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3845  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.79155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  33.03 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  35.58 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.52 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  33.86 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.44 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  35.08 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.93 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4469  putative two-component system sensor kinase  34.97 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.79 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  35.02 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02990  signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3356  histidine kinase  38.24 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10189  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4052  histidine kinase  37.84 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  36.15 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  37.61 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4118  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  32.91 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  32.68 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  32.08 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  32.95 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3913  histidine kinase  31.9 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  35.48 
 
 		 447 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  35.16 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1620  histidine kinase  37.56 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  37.41 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  36.02 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  39.22 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  35.91 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  36.49 
 
 		 442 aa  79.3  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 374 aa  79.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.551521  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  34.51 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.41 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  35.94 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4945  histidine kinase  35.71 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.96 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  33.18 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.4 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  37.79 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1768  histidine kinase  32.69 
 
 		 666 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.686261  normal  0.0755696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3677  histidine kinase  31.48 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1821  histidine kinase  31.06 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  0.0945618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0540  histidine kinase  33.75 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  33.7 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  35.14 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  32.66 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1124  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  32.24 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 500 aa  76.6  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  35.09 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3520  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.71 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>