More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4118 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4118  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  100 
 
 		 376 aa  709    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  38.5 
 
 		 442 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.36 
 
 		 370 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 403 aa  143  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  36 
 
 		 380 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  35.23 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  37 
 
 		 378 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  35.39 
 
 		 372 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  33.25 
 
 		 375 aa  133  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  39.51 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  35.73 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  43.75 
 
 		 406 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 394 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  34.83 
 
 		 380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  41.92 
 
 		 402 aa  126  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  42.11 
 
 		 442 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  38.2 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  32.14 
 
 		 433 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  41.18 
 
 		 401 aa  122  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  32.26 
 
 		 405 aa  123  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  39.37 
 
 		 430 aa  122  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  36.47 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  33.72 
 
 		 478 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0103  histidine kinase  41.69 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  37.96 
 
 		 399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1732  histidine kinase  31.75 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  39.41 
 
 		 462 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  38.99 
 
 		 402 aa  119  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  31.98 
 
 		 438 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2467  histidine kinase  42.93 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  39.9 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 500 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5402  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.83 
 
 		 408 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  43.11 
 
 		 428 aa  116  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  41.81 
 
 		 443 aa  116  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  41.01 
 
 		 367 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0957  histidine kinase  35.74 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  41.27 
 
 		 421 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  39.35 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 420 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  40.93 
 
 		 430 aa  113  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4945  histidine kinase  39.25 
 
 		 351 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  36.22 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 445 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  36.11 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4052  histidine kinase  41.03 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.5 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000329191  unclonable  0.0000000414728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  36.89 
 
 		 470 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4946  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 793 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  37.33 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  34.93 
 
 		 379 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.89 
 
 		 378 aa  109  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 421 aa  109  8.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  40.2 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.109837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  31.98 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  37.1 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  37.63 
 
 		 447 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.75 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 406 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2226  histidine kinase  34.62 
 
 		 370 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  36.06 
 
 		 381 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.65 
 
 		 386 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  38.27 
 
 		 408 aa  106  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  35.98 
 
 		 408 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2657  histidine kinase  32.61 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.13 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0277  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110389 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  35.9 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0608  histidine kinase  40.5 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8565  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.45 
 
 		 407 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  38.42 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  32.74 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  36.41 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0623  histidine kinase  37.67 
 
 		 403 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  34.89 
 
 		 417 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 424 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0295  histidine kinase  41.85 
 
 		 389 aa  103  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.856795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 441 aa  102  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 445 aa  102  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  36.7 
 
 		 382 aa  102  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 612 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.68 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  36.93 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.36 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  37.74 
 
 		 449 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  39.51 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  36.53 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5551  histidine kinase  37.44 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  0.129441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  41.28 
 
 		 372 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>