More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3388 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  100 
 
 		 402 aa  774    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  43.9 
 
 		 393 aa  234  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  41.53 
 
 		 408 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  41.08 
 
 		 442 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 496 aa  193  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  42.29 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4685  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 467 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1617  histidine kinase  47.13 
 
 		 391 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  37.89 
 
 		 380 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 394 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  34.69 
 
 		 400 aa  166  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  40.12 
 
 		 395 aa  164  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  37.72 
 
 		 414 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  35.98 
 
 		 405 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  37.61 
 
 		 399 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  41.18 
 
 		 380 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  39.88 
 
 		 372 aa  156  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  37.91 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  36.69 
 
 		 381 aa  152  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  35.53 
 
 		 410 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  35.38 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  37.39 
 
 		 393 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.84 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  38.61 
 
 		 417 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  38.69 
 
 		 428 aa  149  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  35.42 
 
 		 430 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  33.33 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  34.43 
 
 		 439 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  34.01 
 
 		 378 aa  139  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.71 
 
 		 443 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  34.9 
 
 		 428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19750  signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 439 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  38.92 
 
 		 462 aa  136  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.06 
 
 		 430 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  35.85 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  34.71 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  36.23 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1732  histidine kinase  34.27 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  37.39 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  36.57 
 
 		 399 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 444 aa  133  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  35.97 
 
 		 423 aa  133  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  37.5 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  44.44 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37870  signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 		 423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  33.16 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  33.53 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.39 
 
 		 380 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  38.93 
 
 		 408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.76 
 
 		 386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  33.09 
 
 		 478 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  35.8 
 
 		 399 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  30.81 
 
 		 424 aa  129  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 		 406 aa  129  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  32.71 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  36.26 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  33.24 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  33.24 
 
 		 438 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  32.9 
 
 		 384 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  40.25 
 
 		 388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 394 aa  127  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  38.11 
 
 		 430 aa  127  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.66 
 
 		 379 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.8 
 
 		 378 aa  126  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.05 
 
 		 357 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  40.61 
 
 		 470 aa  126  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2467  histidine kinase  42.66 
 
 		 409 aa  126  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  32.95 
 
 		 442 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1402  putative two-component system sensor kinase  39.18 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  32.53 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  32.05 
 
 		 422 aa  124  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.9 
 
 		 401 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 612 aa  124  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4945  histidine kinase  42.79 
 
 		 351 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25050  signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 360 aa  123  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193402  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 		 360 aa  123  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.109837 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 424 aa  122  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33000  signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 411 aa  122  9e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.53 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  36.34 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.29 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4118  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  34.08 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 424 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2459  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.33 
 
 		 384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 423 aa  120  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 386 aa  119  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 441 aa  119  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2226  histidine kinase  42.86 
 
 		 370 aa  119  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  37.58 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>