More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2390 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
445 aa  858    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  55.78 
 
 
420 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  51.06 
 
 
422 aa  375  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  57.11 
 
 
423 aa  364  1e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.75 
 
 
394 aa  276  5e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  41.61 
 
 
397 aa  271  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
441 aa  239  5.999999999999999e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  43.49 
 
 
408 aa  229  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 
420 aa  223  7e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  47.96 
 
 
447 aa  223  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  42.03 
 
 
410 aa  221  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  41.06 
 
 
417 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  40.52 
 
 
402 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  45.98 
 
 
384 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  43.16 
 
 
407 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  42.5 
 
 
395 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  39.25 
 
 
405 aa  206  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  38.73 
 
 
439 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  40.07 
 
 
399 aa  186  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  43.46 
 
 
443 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  39.67 
 
 
400 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  43.73 
 
 
421 aa  179  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.28 
 
 
386 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.08 
 
 
424 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.62 
 
 
378 aa  173  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.97 
 
 
394 aa  172  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 
398 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  34.93 
 
 
443 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  39.26 
 
 
428 aa  171  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0670  signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 
869 aa  170  5e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  34.29 
 
 
430 aa  169  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  38.44 
 
 
384 aa  168  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 
424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 
441 aa  166  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.23 
 
 
470 aa  166  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.05 
 
 
500 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.03 
 
 
406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  45.49 
 
 
383 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.86 
 
 
392 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  42.86 
 
 
462 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  37.1 
 
 
442 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  37.91 
 
 
394 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
439 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  35.99 
 
 
392 aa  160  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.24 
 
 
392 aa  159  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  40.53 
 
 
367 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 
405 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  37.46 
 
 
372 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  41.15 
 
 
388 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03530  signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 
484 aa  157  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.77 
 
 
406 aa  156  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  36.63 
 
 
372 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  36.73 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  34.2 
 
 
430 aa  154  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4068  histidine kinase  39.41 
 
 
383 aa  153  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.419226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
403 aa  153  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2450  histidine kinase  37.47 
 
 
432 aa  153  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.516192  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4052  histidine kinase  39.26 
 
 
385 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6695  two component LuxR family transcriptional regulator  41.52 
 
 
398 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3913  histidine kinase  32.82 
 
 
458 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  41.05 
 
 
449 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  33.69 
 
 
381 aa  151  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  35.71 
 
 
399 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  43.48 
 
 
408 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2680  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.92 
 
 
271 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.913052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 
524 aa  149  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00577691  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 
469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  37.5 
 
 
438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  38.62 
 
 
478 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  40.81 
 
 
372 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04490  signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 
469 aa  146  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  32.51 
 
 
384 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  38.1 
 
 
407 aa  146  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  34.85 
 
 
399 aa  146  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  36.51 
 
 
433 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  41.23 
 
 
369 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.43 
 
 
400 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0607  histidine kinase  38.67 
 
 
434 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  36.03 
 
 
393 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  38.93 
 
 
395 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.76 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7811  histidine kinase  37.77 
 
 
291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0645  histidine kinase  32.71 
 
 
849 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.386333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.13 
 
 
379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  41.7 
 
 
419 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
441 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 
503 aa  139  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4135  putative signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 
444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  42.15 
 
 
457 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0325  putative two-component system sensor kinase  35.64 
 
 
392 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  32.71 
 
 
393 aa  137  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  32.54 
 
 
399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21890  histidine kinase  44.32 
 
 
473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000762776  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.67 
 
 
401 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
496 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.1 
 
 
430 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.24 
 
 
370 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 
416 aa  133  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>