More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0295 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0295  histidine kinase  100 
 
 		 389 aa  735    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.856795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.69 
 
 		 424 aa  229  7e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.68 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  42.86 
 
 		 446 aa  216  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4218  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.87 
 
 		 398 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0481493  hitchhiker  0.000385051 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.9 
 
 		 386 aa  204  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1602  histidine kinase  42.86 
 
 		 425 aa  199  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  39.57 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  41.18 
 
 		 384 aa  188  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.51 
 
 		 469 aa  184  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  38.24 
 
 		 367 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.43 
 
 		 401 aa  174  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8798  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.61 
 
 		 419 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  38.95 
 
 		 389 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.44 
 
 		 379 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2690  histidine kinase  39.27 
 
 		 445 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.172281 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2232  putative two-component sensor kinase  42.94 
 
 		 375 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  45.76 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.85 
 
 		 418 aa  155  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.85 
 
 		 417 aa  153  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 435 aa  153  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  34.62 
 
 		 424 aa  149  6e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1124  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 422 aa  149  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4673  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.58 
 
 		 399 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113165  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5069  histidine kinase  38.87 
 
 		 403 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  38.78 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  38.11 
 
 		 442 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  43.32 
 
 		 369 aa  146  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0760  histidine kinase  42.8 
 
 		 461 aa  144  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 449 aa  143  7e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2490  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.18 
 
 		 383 aa  142  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26890  signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 		 430 aa  142  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.304615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  44.62 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06240  histidine kinase  45.45 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 		 394 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 		 394 aa  139  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  36.8 
 
 		 399 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0177  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  39.87 
 
 		 386 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  40.38 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  33.63 
 
 		 400 aa  136  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.95 
 
 		 415 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  37.16 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  39.03 
 
 		 423 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25050  signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7657  histidine kinase  40.44 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  40.45 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  41.44 
 
 		 399 aa  131  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 441 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.68 
 
 		 370 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 		 416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 496 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4118  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  44.54 
 
 		 376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  38.15 
 
 		 397 aa  130  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.26 
 
 		 430 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  38.31 
 
 		 438 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  39.13 
 
 		 433 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  44.78 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  39.04 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.99 
 
 		 371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  40.97 
 
 		 428 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.51 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  39.82 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  43.59 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  36.98 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  36.8 
 
 		 478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  38.03 
 
 		 447 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  34.78 
 
 		 405 aa  126  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.74 
 
 		 424 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  38.15 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1884  histidine kinase  43.24 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0784201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5263  histidine kinase  39.85 
 
 		 518 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 441 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  39.11 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  36.77 
 
 		 442 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 405 aa  123  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 536 aa  123  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  41.3 
 
 		 430 aa  122  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 		 403 aa  122  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  41.2 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  41.11 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  38.34 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  42.58 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  33.23 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  41.44 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  40.93 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  43.06 
 
 		 555 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  40.25 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  38.85 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  40.27 
 
 		 382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  37.01 
 
 		 399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 441 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02410  signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>