More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1985 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  100 
 
 		 389 aa  765    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  47.03 
 
 		 367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  45.24 
 
 		 384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.3 
 
 		 417 aa  249  8e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.08 
 
 		 418 aa  247  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 		 424 aa  242  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  39.78 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1602  histidine kinase  41.93 
 
 		 425 aa  232  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  38.89 
 
 		 446 aa  230  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 		 449 aa  226  4e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  40.34 
 
 		 424 aa  224  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.6 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4673  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.61 
 
 		 399 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113165  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0760  histidine kinase  40.62 
 
 		 461 aa  205  9e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4218  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.1 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0481493  hitchhiker  0.000385051 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 		 469 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8798  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.37 
 
 		 419 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  38.78 
 
 		 393 aa  192  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.2 
 
 		 394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.5 
 
 		 401 aa  189  5.999999999999999e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26890  signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.304615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2690  histidine kinase  35.48 
 
 		 445 aa  179  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.172281 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2490  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 		 383 aa  179  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1124  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 		 422 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 435 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.08 
 
 		 424 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2232  putative two-component sensor kinase  36.05 
 
 		 375 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5069  histidine kinase  36.54 
 
 		 403 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.75 
 
 		 415 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25050  signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 360 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193402  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 		 416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.28 
 
 		 379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  35.12 
 
 		 445 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  37.13 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0177  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  34.45 
 
 		 386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0295  histidine kinase  41.61 
 
 		 389 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.856795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  34.95 
 
 		 428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 420 aa  137  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  41.8 
 
 		 374 aa  135  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.71 
 
 		 371 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  33.98 
 
 		 420 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7657  histidine kinase  44.94 
 
 		 434 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06240  histidine kinase  35.33 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1884  histidine kinase  43.7 
 
 		 383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0784201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  34.64 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 373 aa  126  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  33.13 
 
 		 388 aa  126  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0367  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 413 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0318683  normal  0.223079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  38.93 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25610  histidine kinase  33.6 
 
 		 458 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.309786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  33.61 
 
 		 399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  31.52 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.15 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 		 394 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  33.98 
 
 		 555 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02410  signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 428 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  32.56 
 
 		 442 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 441 aa  116  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4996  histidine kinase  35.71 
 
 		 405 aa  116  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  32.95 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  31.5 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  33.33 
 
 		 408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 612 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  37.01 
 
 		 395 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  30.13 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  34.35 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 536 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 441 aa  109  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  33.7 
 
 		 388 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  31.11 
 
 		 380 aa  109  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  31.5 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  32.63 
 
 		 375 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  30.75 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  29.29 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  31.82 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  34.13 
 
 		 422 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6695  two component LuxR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.64 
 
 		 392 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21610  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 423 aa  106  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  38.16 
 
 		 372 aa  106  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  33.06 
 
 		 421 aa  106  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.55 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8899  histidine kinase  32.2 
 
 		 455 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  37.68 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5263  histidine kinase  33.15 
 
 		 518 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  29.7 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 439 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  30.47 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 445 aa  103  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 394 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1603  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  31.17 
 
 		 470 aa  103  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  33.72 
 
 		 422 aa  103  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  34.77 
 
 		 417 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 404 aa  102  9e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  35.39 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  30.31 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>