More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2690 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2690  histidine kinase  100 
 
 
445 aa  862    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.172281 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1124  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.14 
 
 
422 aa  295  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26890  signal transduction histidine kinase  41.93 
 
 
430 aa  266  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.304615  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.75 
 
 
424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  41.12 
 
 
393 aa  244  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5069  histidine kinase  42.76 
 
 
403 aa  243  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1602  histidine kinase  41.15 
 
 
425 aa  233  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  39.29 
 
 
446 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8798  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.06 
 
 
419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  38.3 
 
 
367 aa  207  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.06 
 
 
435 aa  202  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613873  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.63 
 
 
386 aa  199  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  40.49 
 
 
384 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2232  putative two-component sensor kinase  41.41 
 
 
375 aa  192  8e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
418 aa  190  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
394 aa  186  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4218  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.19 
 
 
398 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0481493  hitchhiker  0.000385051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.98 
 
 
389 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 
417 aa  180  4.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 
469 aa  178  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4673  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.33 
 
 
399 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113165  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  34.65 
 
 
424 aa  162  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 
424 aa  160  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  36.87 
 
 
393 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 
401 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25050  signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
360 aa  153  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193402  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0760  histidine kinase  36.39 
 
 
461 aa  152  8.999999999999999e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
449 aa  149  8e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.89 
 
 
379 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0367  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 
413 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0318683  normal  0.223079 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2490  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 
383 aa  131  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  36.96 
 
 
388 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  35.9 
 
 
395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0295  histidine kinase  38.97 
 
 
389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.856795  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  38.41 
 
 
420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25610  histidine kinase  38.52 
 
 
458 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.309786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  31.98 
 
 
375 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  34.25 
 
 
374 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0177  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.22 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06240  histidine kinase  40.42 
 
 
438 aa  119  7.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.03 
 
 
415 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  32.62 
 
 
438 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 
416 aa  117  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
536 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 
373 aa  116  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
612 aa  113  8.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02410  signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 
428 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  35.98 
 
 
369 aa  111  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  29.85 
 
 
371 aa  110  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  32.56 
 
 
430 aa  110  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 
405 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19750  signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
406 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  31.78 
 
 
445 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.1 
 
 
371 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  36.51 
 
 
555 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
441 aa  106  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  30 
 
 
400 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1884  histidine kinase  34.57 
 
 
383 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0784201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  31.9 
 
 
399 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  30.54 
 
 
399 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  37.04 
 
 
428 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7657  histidine kinase  41.29 
 
 
434 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
420 aa  103  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15920  signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
367 aa  103  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.89616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
496 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.91 
 
 
422 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  32.82 
 
 
384 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
403 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  32.11 
 
 
423 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2556  histidine kinase  36.11 
 
 
416 aa  98.2  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121674  normal  0.0692801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  29.1 
 
 
401 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3697  histidine kinase  36.86 
 
 
313 aa  97.1  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  29.62 
 
 
380 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
438 aa  95.9  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  31.61 
 
 
410 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1620  histidine kinase  31.71 
 
 
380 aa  95.1  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  29.47 
 
 
408 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  28.57 
 
 
414 aa  94.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  31.31 
 
 
442 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4261  histidine kinase  35.42 
 
 
429 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5263  histidine kinase  31.1 
 
 
518 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  32.75 
 
 
442 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6236  histidine kinase  35.34 
 
 
387 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.39934  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1603  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  29.59 
 
 
470 aa  91.7  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  29.02 
 
 
379 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
441 aa  91.3  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  26.91 
 
 
381 aa  90.9  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
426 aa  90.9  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0276057  hitchhiker  0.000366543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  30.9 
 
 
478 aa  90.9  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  32.2 
 
 
417 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  36.07 
 
 
388 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  31.18 
 
 
405 aa  90.5  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  35.18 
 
 
392 aa  90.1  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4996  histidine kinase  44.64 
 
 
405 aa  90.1  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4685  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
467 aa  90.1  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.98 
 
 
407 aa  89.7  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0103  histidine kinase  34.33 
 
 
393 aa  89.7  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105504  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.92 
 
 
430 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21610  signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
423 aa  89  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334304  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>