More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4416 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 386 aa  755    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8798  Signal transduction histidine kinase-like protein  58.33 
 
 		 419 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2232  putative two-component sensor kinase  56.54 
 
 		 375 aa  368  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.24 
 
 		 424 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1602  histidine kinase  48.12 
 
 		 425 aa  290  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  43.04 
 
 		 446 aa  266  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  43.38 
 
 		 393 aa  252  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  44.2 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.31 
 
 		 435 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1124  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 		 422 aa  243  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.72 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.76 
 
 		 469 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  43.11 
 
 		 389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  40.57 
 
 		 367 aa  217  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  43.71 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2690  histidine kinase  39.39 
 
 		 445 aa  206  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.172281 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.13 
 
 		 401 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4218  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.77 
 
 		 398 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0481493  hitchhiker  0.000385051 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26890  signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 430 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.304615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0760  histidine kinase  40.39 
 
 		 461 aa  192  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 417 aa  187  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 		 449 aa  184  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5069  histidine kinase  39.15 
 
 		 403 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  34.54 
 
 		 424 aa  182  8.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 418 aa  182  8.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4673  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.03 
 
 		 399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113165  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0295  histidine kinase  44.59 
 
 		 389 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.856795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25050  signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 360 aa  162  9e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7657  histidine kinase  40.17 
 
 		 434 aa  159  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.28 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  38.26 
 
 		 374 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06240  histidine kinase  45.97 
 
 		 438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  39.2 
 
 		 369 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.26 
 
 		 415 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0177  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  38.95 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 424 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2490  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 		 383 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0367  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 413 aa  143  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0318683  normal  0.223079 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 		 536 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  42.68 
 
 		 420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  43.51 
 
 		 555 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  34.56 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1884  histidine kinase  37.2 
 
 		 383 aa  133  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0784201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  41.95 
 
 		 395 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  33.85 
 
 		 371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  33.7 
 
 		 442 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.76 
 
 		 371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  35.69 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25610  histidine kinase  32.49 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.309786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  34.67 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  37.92 
 
 		 423 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  37.5 
 
 		 445 aa  126  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 373 aa  126  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  34.64 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  36.55 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  38.04 
 
 		 428 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  32.55 
 
 		 395 aa  123  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15920  signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 367 aa  122  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.89616 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3997  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.7 
 
 		 567 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224789  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  35.81 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  31.82 
 
 		 430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  31.49 
 
 		 381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  33.42 
 
 		 405 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  33.24 
 
 		 402 aa  119  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  29.9 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  31.02 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  32.76 
 
 		 408 aa  117  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 441 aa  116  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 403 aa  116  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02410  signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  30.47 
 
 		 379 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 394 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  32.17 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  29.94 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.48 
 
 		 424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  34.29 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  30.33 
 
 		 400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  33.25 
 
 		 443 aa  111  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4996  histidine kinase  45.08 
 
 		 405 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  32.02 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  31.03 
 
 		 380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0277  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 426 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110389 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2252  histidine kinase  40.3 
 
 		 386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  32.89 
 
 		 410 aa  110  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  32.39 
 
 		 367 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  35.1 
 
 		 384 aa  110  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 445 aa  109  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1603  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  32.89 
 
 		 470 aa  109  8.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  37.62 
 
 		 395 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8899  histidine kinase  31.76 
 
 		 455 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  32.21 
 
 		 422 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  30.75 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.74 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 612 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 406 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>