More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2413 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 373 aa  720    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  43.55 
 
 		 375 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  45.43 
 
 		 371 aa  233  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  41.72 
 
 		 445 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.05 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  35.11 
 
 		 393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 		 424 aa  152  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 		 469 aa  152  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15920  signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 367 aa  152  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.89616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 416 aa  150  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.54 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.64 
 
 		 384 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  39.22 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.28 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25050  signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 		 360 aa  143  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193402  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  35.85 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 424 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  41.15 
 
 		 393 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  44.49 
 
 		 395 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7657  histidine kinase  46.7 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1602  histidine kinase  37.32 
 
 		 425 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.98 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  39.92 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 		 536 aa  133  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  34.47 
 
 		 442 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4996  histidine kinase  44.58 
 
 		 405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  32.76 
 
 		 367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  34.67 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 420 aa  127  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  35.31 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  34.22 
 
 		 389 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2232  putative two-component sensor kinase  44.56 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  37.39 
 
 		 422 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  44.83 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0760  histidine kinase  33.43 
 
 		 461 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 		 386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1884  histidine kinase  34.86 
 
 		 383 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0784201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0177  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  36.15 
 
 		 386 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  36.14 
 
 		 399 aa  119  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 403 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 441 aa  119  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4673  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.43 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113165  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  32.33 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  40 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 496 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8899  histidine kinase  32.76 
 
 		 455 aa  116  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  35.69 
 
 		 442 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  35.02 
 
 		 446 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2690  histidine kinase  41.28 
 
 		 445 aa  115  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.172281 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0277  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 426 aa  115  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110389 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  43.84 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06240  histidine kinase  35.21 
 
 		 438 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26890  signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.304615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3845  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.4 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.79155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  39.85 
 
 		 393 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1124  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0103  histidine kinase  39.15 
 
 		 393 aa  113  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.89 
 
 		 400 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4218  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.85 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0481493  hitchhiker  0.000385051 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  32.5 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  38.04 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  38.89 
 
 		 457 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7014  histidine kinase  41.03 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149042  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  34.33 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  37.05 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 441 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0309  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  34.02 
 
 		 384 aa  110  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8798  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.66 
 
 		 419 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  37.6 
 
 		 402 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 417 aa  110  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  35.32 
 
 		 438 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1618  histidine kinase  36.02 
 
 		 369 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.790794  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  35.53 
 
 		 430 aa  110  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  38.33 
 
 		 399 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1603  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  32.52 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  31.14 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  32.9 
 
 		 376 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4578  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.59 
 
 		 370 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21610  signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 		 435 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 364 aa  106  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.21 
 
 		 370 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  32.38 
 
 		 402 aa  106  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  32.55 
 
 		 443 aa  106  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  36.68 
 
 		 374 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  32.89 
 
 		 430 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  32.5 
 
 		 422 aa  106  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 		 500 aa  105  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  30.5 
 
 		 401 aa  105  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  35.29 
 
 		 408 aa  105  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.53 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 449 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  29.62 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>