More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7210 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 
379 aa  728    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  51.82 
 
 
371 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  58.23 
 
 
416 aa  238  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
424 aa  237  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1884  histidine kinase  57.55 
 
 
383 aa  222  7e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0784201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  56.3 
 
 
369 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.31 
 
 
415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.19 
 
 
469 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  48.78 
 
 
393 aa  176  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.79 
 
 
424 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  49 
 
 
420 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0367  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.92 
 
 
413 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0318683  normal  0.223079 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  45.77 
 
 
428 aa  166  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  42.95 
 
 
428 aa  166  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.24 
 
 
418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.71 
 
 
417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  37.03 
 
 
446 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.53 
 
 
424 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 
386 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  40.73 
 
 
405 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  40 
 
 
424 aa  157  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  45 
 
 
386 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  45.42 
 
 
384 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25050  signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 
360 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193402  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  41.76 
 
 
389 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1602  histidine kinase  44.07 
 
 
425 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4996  histidine kinase  40 
 
 
405 aa  152  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  42.16 
 
 
399 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  42.21 
 
 
445 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.02 
 
 
373 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  36.15 
 
 
423 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 
420 aa  150  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  42.4 
 
 
395 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 
536 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  44.17 
 
 
393 aa  146  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  46.5 
 
 
392 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.15 
 
 
435 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613873  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
441 aa  144  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.49 
 
 
394 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  41 
 
 
400 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  43.46 
 
 
388 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
394 aa  143  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
394 aa  142  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  44.58 
 
 
388 aa  142  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4218  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.9 
 
 
398 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0481493  hitchhiker  0.000385051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  40.94 
 
 
555 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7657  histidine kinase  48.73 
 
 
434 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  36.5 
 
 
371 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.7 
 
 
400 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2690  histidine kinase  43.87 
 
 
445 aa  139  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.172281 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  40.84 
 
 
367 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  40.16 
 
 
433 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  38.22 
 
 
478 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  40.73 
 
 
397 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  39.92 
 
 
422 aa  138  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  41.2 
 
 
410 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
403 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 
387 aa  137  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  40.39 
 
 
417 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  45.11 
 
 
443 aa  136  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  41.18 
 
 
408 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  41.28 
 
 
374 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  39.09 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8798  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.52 
 
 
419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 
449 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  38.78 
 
 
430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  38.6 
 
 
399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
612 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  40.32 
 
 
402 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  33.14 
 
 
401 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.93 
 
 
406 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26890  signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
430 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.304615  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0957  histidine kinase  46.67 
 
 
378 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  34.63 
 
 
395 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  34.97 
 
 
408 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  33.52 
 
 
375 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  42.8 
 
 
419 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0295  histidine kinase  42.96 
 
 
389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.856795  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  43.1 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  36.33 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  32.46 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
445 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1124  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 
422 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  39.45 
 
 
430 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4261  histidine kinase  40.15 
 
 
429 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  39.84 
 
 
442 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  37.6 
 
 
399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
405 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 
500 aa  129  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  41.29 
 
 
401 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25610  histidine kinase  40.08 
 
 
458 aa  129  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.309786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4673  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.93 
 
 
399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113165  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  41.25 
 
 
443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  42.66 
 
 
457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  35.73 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.51 
 
 
378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>