More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5192 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  100 
 
 		 445 aa  855    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15920  signal transduction histidine kinase  55.24 
 
 		 367 aa  306  5.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.89616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  44.19 
 
 		 371 aa  237  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  43.39 
 
 		 375 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.21 
 
 		 373 aa  189  9e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.36 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 		 536 aa  146  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.5 
 
 		 379 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 424 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  40.75 
 
 		 420 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 441 aa  140  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.68 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  34.83 
 
 		 438 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  39.47 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  42.92 
 
 		 408 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 		 469 aa  137  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 405 aa  136  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  39.54 
 
 		 395 aa  136  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 		 394 aa  133  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  39.26 
 
 		 393 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  33.7 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  34.51 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8899  histidine kinase  32.63 
 
 		 455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  38.72 
 
 		 428 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  35.58 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.03 
 
 		 371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  34.99 
 
 		 380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  41.08 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  44.44 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  40.25 
 
 		 367 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  34.44 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 496 aa  126  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  41.63 
 
 		 380 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  32.14 
 
 		 446 aa  123  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  30.42 
 
 		 401 aa  123  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 421 aa  123  7e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  41.05 
 
 		 399 aa  123  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  38.52 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.87 
 
 		 400 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  37.55 
 
 		 393 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  36.19 
 
 		 399 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 420 aa  120  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  40.67 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  34.25 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.55 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  40.29 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0367  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0318683  normal  0.223079 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  38.31 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  36.32 
 
 		 478 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  36.56 
 
 		 388 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  37.12 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  36.82 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.14 
 
 		 443 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25050  signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193402  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  40.61 
 
 		 395 aa  114  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  40.69 
 
 		 381 aa  114  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 439 aa  114  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  41.67 
 
 		 382 aa  113  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 424 aa  112  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 404 aa  112  9e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.76 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  32.2 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  39.17 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  38.02 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  37.5 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  43.84 
 
 		 357 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  40.64 
 
 		 422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  37.8 
 
 		 397 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2450  histidine kinase  41.92 
 
 		 432 aa  111  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.516192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1618  histidine kinase  39.69 
 
 		 369 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.790794  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  34.22 
 
 		 400 aa  110  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 612 aa  109  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  39.33 
 
 		 443 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  38.14 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3845  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.79155 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2690  histidine kinase  31.78 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.172281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8798  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.97 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4996  histidine kinase  40.18 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  36.47 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 449 aa  107  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39190  signal transduction histidine kinase  38.8 
 
 		 601 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.240452 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  41.18 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5402  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.25 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  37.34 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0277  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 426 aa  107  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110389 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0103  histidine kinase  42.73 
 
 		 393 aa  107  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7657  histidine kinase  41.87 
 
 		 434 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  35.86 
 
 		 433 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  35.48 
 
 		 462 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1884  histidine kinase  38.66 
 
 		 383 aa  106  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0784201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>